云台山白云岩表层土可培养细菌多样性-云南大学.PDF

云南大学学报（自然科学版），２０１５，３７（４）：６１６～６２２ ＤＯＩ：１０．７５４０／ｊ．ｙｎｕ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｙｕｎｎａｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ 云台山白云岩表层土可培养细菌多样性∗ １ １ １ ２ １ １ １ １ １ 王玉倩 ，潘舟强 ，翁庆北 ， 肖　 炜 ，龚　 敏 ，卢玉兵 ，陈晓旺 ，李　 敏 ，方　 正 （１．贵州师范大学 生命科学学院，贵州 贵阳　 ５５０００１；２．云南大学 云南省微生物研究所，云南 昆明　 ６５００９１） 摘要：运用纯培养法和基于１６ＳｒＲＮＡ基因序列的系统发育分析贵州云台山白云岩表层土可培养细菌的多 样性．稀释涂布平板分离共获得 １３１株细菌，限制性内切酶Ｈｈａ Ⅰ和ＨａｅⅢ对扩增的１６Ｓ ｒＲＮＡ基因片段进行酶 切分型，根据ＡＲＤＲＡ酶切图谱划分为４０个操作分类单元．１６Ｓ ｒＲＮＡ基因序列测定和系统发育分析结果显示， － － － － 这些菌株隶属于包括厚壁菌门（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ，６４．８９％）、β 变形菌纲（β Ｐｒｏｔｅｒｂａｃｔｅｒｉａ，３．８２％）、γ 变形菌纲（γ Ｐｒｏｔｅｒｂａｃｔｅｒｉａ，１７．５６％）、放线细菌门（Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ，１１．４５％）和拟杆菌门（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ，３．８２％）等５大类群，共 １３个属．优势菌群为芽胞杆菌属（Ｂａｃｉｌｌｕｓ，５３．４４％），亚优势菌群为寡养单胞菌属（Ｓｔｅｎｏｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ，９．１６％）、假 单胞菌属（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ，８．４０％）和微小杆菌属（Ｅｘｉｇｕｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ，８．４０％）．１５．００％的有效序列与ＧｅｎｅＢａｎｋ 已知 序列相似性小于等于９７％，可能为潜在新类群．研究表明，云台山白云岩喀斯特地区不仅含有较为丰富的细菌 物种多样性，且潜藏着许多新的微生物资源． 关键词：白云岩；喀斯特；可培养细菌；１６Ｓ ｒＲＮＡ；多样性 － － － 中图分类号：Ｑ９３８．１　 　 文献标志码：Ａ　 　 文章编号：０２５８ ７９７１（２０１５）０４ ０６１６ ０７ － ［７ ８］ 　 　 微生物参与许多涉及喀斯特地区演化历程的 斯特生态系统中具有重要作用 ，在某些地区也 － 地质地球化学作用过程，特别是岩石、矿物的沉积 是岩石风化的优势和先锋物种［４，９ １０］．但目前对岩 和风化，土壤的形成与演化过程，导致生物喀斯特 石表面微生物研究主要为蓝细菌和真菌等，对异养 － ［１ ２］ ［１１］ 地貌形成 ．已有研究表明，无论是坚硬的花岗岩 细菌种群的生物多样性仍了解较少 ． 或砂岩、石灰岩、白云岩等多孔岩石，许多类型的岩