分子血缘相关矩阵和其逆阵建立.docVIP

实习四 分子血缘相关矩阵及其逆阵的建立 一、实习目的 1．掌握分子血缘相关矩阵A的建立原理和方法 2．掌握从系谱直接构建A-1的原理和方法 二、原理与方法 (一) A阵的构建方法 对于一个由n个个体组成的群体，所有个体间的加相遗传相关可用一个矩阵表示为： A= 其中为个体和个体之间的加性遗传相关矩阵(Additive genetic relationship matrix)。由于其中的元素是Wright计算亲缘相关系数公式中的分子部分，因而又称之为分子血缘相关矩阵(numerator relationship matrix)。 根据如下2个递推公式可以计算A中的每一个元素： 式中，和表示个体的父亲和母亲； 和表示个体的父亲和母亲； 为和间的加性遗传相关（当个体的双亲或一个亲本未知时，）； 和分别为个体与和间的加性遗传相关（当个体的父亲未知时，=0;当个体的母亲未知时，=0）； 为个体的近交系数。 A阵构建步骤： 1．所有个体按个体号、父号和母号列成一个3列表。例如有7个个体，列成如下列表： 个体 父亲 母亲 1 — — 2 — — 3 1 — 4 1 2 5 3 4 6 1 4 7 5 6 列表时需注意如下事项： ①在个体一列中应包括所有在父亲和母亲列中出现的个体； ②在个体一列中应保证后代绝不会出现在亲代