病历数据认知属性-生物医学知识整合论.ppt

生物医学知识整合论（The Theory of Biomedical Knowledge Integration, BMKI）(part1) 包含飞 上海中医药大学 中医信息化标准化研究室 201203 科学理论是一个优秀民族的最高精神追求。 一个优秀民族应该“唯理是求”，不应该“唯利是图”。 生命系统——物理整合的大师 是我们人类的科学活动而不是机体本身把机体分解为量子生物学、分子生物学、生物物理学、生物化学、细胞学、组织学、解剖学、生理学、免疫学、遗传学……各层次。相反，大自然把万千机制都有条不紊地融为一体，把无数元素、无数机制融合和联合成一个完美的动态网络。 盲人摸象新说 利用信息整合技术，我们的盲人小组获得了巨大进步。虽然他们各自所拥有的信息丝毫没有增加，但他们所构建的大象模型向真实的大象逼近了一大步。 借此笔者希望阐明生物医学知识整合论的意义：所有的生物学、医学及生物医学信息学的研究和开发都是环绕着机体这同一目标，他们的结果之间必然存在内在的联系。深入探讨、挖掘、建立这些联系有助于我们在整体上对机体的理解，这就是BMKI的根本任务。 Openclincal在其白皮书“医学知识危机及其解决方法知识处理”的总结中说： 1.对于一个没有(医学知识工程)支持的医疗卫生人员，已不可能用传统的方法掌握现代科学知识,即以可能做到的有效而安全的医疗服务所需要的所有知识。 2.后基因时代情况将变得更糟糕。 3.知识危机的一个可能解决方法是采用更为严谨的方法和技术进行知识处理。 4.这种态势尚未被广泛地意识和理解，现有的很多技术的设计不能相互匹配和交互操作。 5. OpenClinical为一个个人，组织和商业公司组成的协会，它的成员认识到在医学中改善知识处理的重要性和相信通过合作和一致性可以达到目的。 “生活在医疗卫生服务发达的富裕国家，我们通常都认为当我们遇到什么医学问题，它们必定会得到及时的有效的与高度发达的医疗事业相称的治疗和处理。一直以来，我们大家期望随着对疾病的科学理解和处理的快速发展不断地得到改善，期望着随后基因时代新知识爆炸获得进一步提高。不幸的是，这种获得最优质的服务的前景并不那么肯定，即使对富裕的阶层。” “我们对疾病的理解和处理的史无前例的发展与实际中应用这些知识的能力并不匹配。这些问题根源是缺乏对新知识的一致性的访问，缺乏足够的资源使大家分享新知识的成果。” 英国i4u的主席Ian Purves 教授来华讲学时提供了一组发生在医疗行业的令人震惊数据： 一个临床医生每年需要阅读16,000篇专业文章（平均每天44篇）以掌握最新的医学信息。 仍存在大量而严重的错误处方。 英国每小时有4个病人死于错误处方。 美国每小时有11个病人（每年约9.8万人）死于错误处方。 美国每年发生近77万起恶性药物事故。 （而50%的这些错误可以在有效的信息管理中避免） 类似地，据英国《泰晤士报》8月13日报道，每年英国至少有7．2万人因医院误诊或医疗事故而无辜丧命，医疗事故变成威胁英国人生命的第四大杀手。而且，不少医院还故意隐瞒医疗事故实际数目，这导致庸医们逍遥法外。 美国Texas州大学张家杰教授在CMIA2005年年会（深圳）大会上发言指出医疗事故死亡的人数每每被医学信息学家形象化地描述“One jumbo jet crash every day”（每天掉一架大型喷气式客机）。 Internet难救**!成为中国首位利用“互联网”寻求拯救的病人。据统计，前后在网上收到1000多封信， ……出院时，家人收到了……50万元账单 十盒盒装的普鲁士蓝，总共四十余元…………严重的后遗症却将和她相伴终生。 结论： 医生的职责为治病救命,结果却往往相反; 病人，医生，人类需要知识工程！ 系统生物学家的梦想 “我们正站在一个令人振奋的新纪元的起点上。在这个新时代中，生物学和信息学的力量将结合起来，共同解决在环境，能源产品和人类健康领域中的重大问题。” -----Genomes to Life Workshop 2001 “Visions for Computational and Systems Biology” 系统生物学家的梦想 “系统生物学不是系统的生物学。它是驾于界于个体成分与系统之间的中间领域，所以它是新领域。它研究从分子走向系统时出现的新特征。它不同于生理学或整体论（Holism）。它也不同于还原学家的事业例如分子生物学，后者只研究各种分子。系统生物学界于二者之间。” -----Hans V. Westerhoff. Ph.D Department of Molecular Cell, Physioloy, BioCentrum Amsterdam W3的梦想