试验进度.DOC

實 驗 進 度 2010-08-18 本研究是將本實驗室所發展的多階電子結構方法 (MLSE-DFT)，我們採用QCISD(T)方法加入apdz (aug-cc-pVDZ)、aptz、apdz+d、aptz+d，進行運算。另外我們也將運算結果與CCSD(T)加上apdz、aptz basis set。並將所得到結果求出平均誤差(MUE)，兩者的DFT的方法因加入不同組合的basis set做比較，獲得較精確的基底函數組合，”自動化計算中心”(9/~computing/)，將自動化中心所內建的小型分子結構的檔案下載，如下圖視窗： 下載Access程式(bc)，並且下載已設定計算方法的小型分子的檔案。 利用FTP軟體將檔案傳回主機，進行解壓縮。 請於主機中進行檔案解壓縮，輸入指令，如下圖所示： 解壓縮完畢之後進入aptz/ (自行編輯的檔名)目錄中檢查，若要將G03改為G09的操作指令如下： 此指令僅將資料夾中的原本g03(g09 (僅改檔名而已)。 若要將所有改成G09則輸入指令如下： 進入sum/ 將g03改為g09 假若我們要將所有job內文執行指令要改為g09.sh指令如下： 將job送算主機runing指令入下圖所示： 將運算完結果數據轉成Excel時，我們利用FTP下載已完成計算的檔案到指定資料夾中，並將檔案做轉換。操作入下圖所示： 若發現有些分子結構並未收歛時，則到主機進行單一個別的分子最佳化運算。操作指令如下:先進入未收斂的資料夾中(vi OH.com) ※將job送算主機runing，輸入指令( g09 OH.com 補完data後將數據進行運算，求出MUE值。 結果與討論： 本計算研究是將最後得到數據求出平均絕對誤差所測試的109個分子的原子化能量(MGAE109)、13個游離能(IP)、13個電子親和力(EA)、38個氫轉移之反應能障(HTBH)、38個非氫轉移之反應能障(NHTBH)。本實驗所用基底含數及基底含數組合，如apdz (aug-cc-pVDZ)、aptz (aug-cc-pVZ)、apdz+d (aug-cc-pVDZ)、aptz+d (aug-cc-pVZ+d)、apdz/aptz、aptz/apdz+d/aptz+d等。所得到的各項中平均絕對誤差值與崇郁學姊以CCSD(T)方法計算所得到的數據做比較，找出兩者理論方法搭配基底函數後最好的基底函數組合搭配，以及最好平均絕對誤差值。 QCISD(T) AE IP EA HTBH NHTBH MUE apdz aptz apdz+d aptz+d apdz/aptz aptz/apdz+d/aptz+d CCSD(T) AE IP EA HTBH NHTBH MUE aptz 12.57 1.95 2.03 0.72 0.64 6.99 apdz/aptz 1.63 0.87 1.01 0.73 0.54 1.19 pdz/apdz/aptz 1.61 0.87 0.69 0.70 0.59 1.16 pdz/ptz/ apdz 2.40 1.27 1.19 0.71 1.31 1.73 之後進度了解高階第一原理Benchmark，Double-Hybrid functional熱力學化學和熱化學動力學。 運算QCISD(T)的MUE之data