一个位于6q22的SNP通过调节HOXB13与染色体的结合影响RFX6的表达课件.ppt

A prostate cancer susceptibility allele at 6q22 increases RFX6 expression by modulating HOXB13 chromatin binding * 背景介绍 基本信息 前列腺癌是指发生在前列腺的上皮性恶性肿瘤，是男性泌尿生殖系统的常见恶性肿瘤。 美国癌症协会的统计数据显示, 前列腺癌的新发病例数在发达国家男性患者所有肿瘤中占第一位, 死亡率仅次于肺癌。而且在目前所有的癌症中，前列腺癌是遗传率最高的一种。 前列腺癌的恶性程度可通过组织学分级进行评估，最常用的是Gleason评分系统，依据前列腺癌组织中主要结构区和次要结构区的评分之和将前列腺癌的恶性程度划分为2～10分，分化最好的是1+1=2分，最差的是5+5=10分。 前列腺癌 * 背景介绍 临床表现 前列腺癌早期常无症状，随着肿瘤的发展，前列腺癌引起的症状可概括为两大类： 1.压迫症状 逐渐增大的前列腺腺体压迫尿道可引起进行性排尿困难，表现为尿线细、射程短、尿流缓慢、尿流中断、尿后滴沥、排尿不尽、排尿费力，此外，还有尿频、尿急、夜尿增多、甚至尿失禁。肿瘤压迫直肠可引起大便困难或肠梗阻，也可压迫输精管引起射精缺乏，压迫神经引起会阴部疼痛，并可向坐骨神经放射。 2.转移症状 前列腺癌可侵及膀胱、精囊、血管神经束，引起血尿、血精、阳痿。盆腔淋巴结转移可引起双下肢水肿。前列腺癌常易发生骨转移，引起骨痛或病理性骨折、截瘫。前列腺癌也可侵及骨髓引起贫血或全血象减少。 前列腺癌 * 背景介绍 治疗方法 根据肿瘤所处阶段的不同采取不同的治疗方法 1.对于早期前列腺癌患者可采用根治性治疗方法，能够治愈早期前列腺癌的方法有放射性粒子植入、根治性前列腺切除术、根治性外放射治疗。 2.对于中期前列腺癌患者应采用综合治疗方法，如手术+放疗、内分泌治疗+放疗等。 3.对激素敏感型晚期前列腺癌患者以内分泌治疗为主，内分泌治疗的方法包括去势（手术去势或药物去势）和抗雄激素治疗（比卡鲁胺或氟他胺）或去势+抗雄激素治疗。但几乎所有患者最终都会发展为激素非依赖性前列腺癌或激素抵抗性前列腺癌。 前列腺癌 * 背景介绍 预防 有研究结果显示番茄和其他含番茄红素的食物对预防前列腺癌可能有效。 二项大规模的前列腺癌预防试验结果显示，应用非那雄胺或度他雄胺（治疗前列腺增生的药物）可使前列腺癌的患病率降低25%，但可能增加患高分级前列腺癌的风险。 前列腺癌 * 背景介绍 单核苷酸多态（Single Nucleotide Polymorphisms） 是指在基因组上单个核苷酸的变异，包括转换、颠换、缺失和插入，形成的遗传标记，其数量很多，多态性丰富。从理论上来看每一个SNP 位点都可以有4 种不同的变异形式,但实际上发生的只有两种，即转换和颠换,二者之比为2：1。SNP 在CG序列上出现最为频繁，而且多是C转换为T ,原因是CG中的胞嘧啶常被甲基化,而后自发地脱氨成为胸腺嘧啶。 SNP * 背景介绍 特性 1.SNP数量多，分布广泛。据估计，人类基因组中每1000个核苷酸就有一个SNP，人类30亿碱基中共有300万以上的SNPs。 2.SNP适于快速、规模化筛查。组成DNA的碱基虽然有4种，但SNP一般只有两种碱基组成，所以它是一种二态的标记，即二等位基因（biallelic）。 由于SNP的二态性，非此即彼，在基因组筛选中SNPs往往只需+/-的分析，而不用分析片段的长度，这就利于发展自动化技术筛选或检测SNPs。 3. SNP等位基因频率的容易估计。 4. 易于基因分型。SNPs 的二态性，也利于对其进行基因分型。 SNP * 实验方法 全基因组关联研究 （Genome-Wide Association Study, GWAS) 研究复杂疾病的易感基因 借助于SNP芯片等新技术，科学家可以同时分析一个人的基因组中的上百万个SNP。把许多（上千个）健康人和疾病患者（这些人不一定必须属于同一个家族）的SNP结果放在一起，找出在患者和健康人中allele frequency 显著不同的SNPs。这些SNP即是和疾病发生相关联的。 由于分析全基因组SNP，不做其他假设，不受对疾病已有认识的限制，可更有效地了解疾病的遗传致病机制 GWAS * 背景介绍 GWAS * 背景介绍 GWAS 方法建立在CDCV假设上. “Common Disease, Common Variant” （CDCV） -复杂疾病的遗传致病因素可以由众多常见SNP（即高频率SNP，