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基因组学方法在植物抗逆性研究中的应用
《生物工程进展》200 1 ,Vol . 2 1 ,No . 1
技术与
方法探讨 基因组学方法在植物抗逆性研究中的应用
贺超英 陈受宜
( 中国科学院遗传研究所植物生物技术实验室 ,100 10 1 ,北京)
(
摘要 由于植物抗逆性遗传极其复杂 , 因而植物抗逆性能 包括抗非生物胁迫如盐碱 、干旱 、低温
)
等的能力和抗生物协迫如真菌 、细菌 、病毒和线虫的能力等 的提高受到了极大限制 。近年来 ,基
因组学的兴起对我们全面理解植物抗逆性起着革命性作用 。结构基因组学将会使我们挖掘大量
全新的抗逆基因 ,并能揭示各抗逆性基因的详细结构以及抗逆性遗传进化机理 。功能基因组学将
会阐明植物抗逆中的复杂的调控网络 ,揭示涉及抗逆蛋白的多样性 。通过比较基因学的研究 ,可
以把从模式植物上获得的抗逆遗传信息推广到基因组较复杂的植物上去 。大规模的全新基因的
发现及其在抗逆反应中的表达模式的研究和它们在抗逆应中作用的理解将会为利用遗传工程进
行植物抗逆育种提供广阔的前景 。
关键词 植物抗逆性 基因组学 结构基因组学 功能基因组学 比较基因组学
( )
环境因子 如干旱 、盐碱和极端低温等 和病虫 高植物抗性提供基础 。本文综述了基因组学的研究
害严重影响农作物的正常生长发育和产量[ 1 ] 。环 方法在植物抗逆性研究中应用的进展 。
境污染和人口爆炸则使粮食的供应更趋紧张 。因而
需要培育高抗性和高产优质的粮食作物[2 ] 。由于 1 结构基因组学( Structural Genomics)
抗逆性状的复杂性和缺乏有效的选择手段 ,难以通 抗性基因的大规模挖掘是研究植物复杂的抗性
过选择或种属间杂交或诱交方式来获得优 良品种 。 机理和提高植物抗逆性的基础 ,而它最终又依赖于
通过抗逆性与产量性状的相关性进行相关育种虽然 大规模的基因组 DNA 测序和在逆境胁迫下的表达
( )
是可行的 ,但抗逆性和数量性状位点 Q TL 的连锁 ( )
序列 Exp ressed Sequence Tags , EST 的测定 ,这也
关系十分复杂 ,在不同的发育时期 ,这种连锁关系也 是结构基因组学的目的。随着高效毛细管测序法 、
会有很大的不同[3 ] 。随着致密的遗传 图谱和物理 DNA 芯片测序法和大规模平行实测法等测序技术
(
图谱的发展 , 利用分子标记辅助选择 Marker A s 的出现 。结合计算机技术的发展 ,使得大规模测序
sisted Selection) 进行抗性品种的选育已成为可能 , 成为可能 。目前 , 已经完成了一批微生物的全基因
但仍不能从根本上来提高作物的抗性 。随着一些与 组序列测定 ,果蝇 、拟南芥等模式生物的基因组序列
抗性相关基因的分离与鉴定以及对抗性机理的深入 即将完成 。随着技术的进一步改进和成本的降低 ,
理解 ,通过直接导入一个或多个基因的遗传工程在 重要农作物和抗性资源的基因组测定 ,尤其是某些
提高植物抗逆性方面则更具前景 。 ( ) [6 ,7 ]
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