肝癌磷蛋白质组学分析和其调控网络研究.pdf

肝癌磷蛋白质组学分析及其调控网络研究 专业名称：生物化学与分子生物学 申请人：陈鹏 指导教师：邹责勉 副主任医师 戴 勇 教 授 论文答辩委员会 主席： 委员： 烨艇 旌垒!壁 ：堡… IIIIIIillI lIllllI!illHmIIIIIH Y2846519 肝癌磷蛋白质组学分析及其调控网络研究 研究生：陈鹏 年级：2012级 导师：邹贵勉副主任医师戴勇教授 专业：生物化学与分子生物学研究方向：重大疾病分子机理 摘要 liver cancer，PLC，以下简称肝癌)是发源于肝脏能引起极高的死 原发性肝癌(primary 亡率的恶性肿瘤。肝癌和肺癌及胃癌并称世界上的三大癌症。肝癌的发病原因较为复杂， 其具体的发病机理尚未完全清楚。目前肝癌的治疗方法主要有肝癌切除手术、移植手术、 全身化学疗等。但由于供体紧张、费用高、术后复发等因素，肝癌的治疗受到了严重的影 响，选择更好的肝癌治疗方法显得迫在眉睫。蛋白质磷酸化修饰是蛋白质翻译后的一种重 要修饰方式，磷酸化修饰在生命的活动过程中起着非常重要的调控作用，它影响着生命的 多种活动，包括细胞的增殖、分化、发育、信号转换和细胞凋亡等。对肝脏癌变组织细胞 进行磷酸化蛋白质组学的研究有助于更深入的了解蛋白磷酸化对肝脏组织细胞的影响，进 一步阐明肝癌疾病发生的分子作用机制，找出该疾病的特异性标记物以及作用靶标，为该 病的治疗提供新的策略和良好的理论基础。 目的：(1)高通量筛选和鉴定肝癌组织细胞和癌旁组织细胞差异表达的蛋白和磷酸化 蛋白，并确定这些蛋白的磷酸化位点。(2)针对磷酸化蛋白的丰度分布进行丰度分析，绘 制磷酸化蛋白丰度分布图。(3)查询差异表达的蛋白及磷酸化蛋白功能并归类，从整体上 建立肝癌疾病的蛋白和磷酸化蛋白组数据库。 方法：采用iTRAQ蛋白标记技术和Ti02磷酸化蛋白富集技术，结合液相串联质谱分 析，对8名肝癌患者移植换下肝脏的癌变组织和癌旁组织中的差异蛋白和磷酸化蛋白质进 行研究，寻找出其中的差异表达。 结果：实验共鉴定到癌变组织细胞组相对于癌旁组表达上调的蛋白158个，下调的蛋 白71个。癌变组织相对于癌旁组织磷酸化肽段差异表达总共87个，其中上调的有56个， 下调的有31个。 结论：(1)肝脏癌变组织与癌旁组织中蛋白的表达和蛋白质的磷酸化修饰存在着显著 差异。(2)肝脏组织中蛋白质的磷酸化与细胞的生物调节、生物转化、新陈代谢和刺激等 生物过程密切相关，可能会在肝癌的发生和发展过程中发挥重要作用。 关键词：原发性肝癌；磷酸化蛋白质组学；蛋白质组；iTRAQ；Ti02 the networkin Researchof and primary Phosphoproteomicsregulatory livercancer Master ChenGrade：2012 Dai candidate：Peng