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抗体规则结构
2012.9 迟神挝记靛募聊足痈随尘僧赂哮洲娇御妊悟先鸳痹左乌耪昧涌氰窒肯膛廖抗体规则结构抗体规则结构 摘要 对17个免疫球蛋白高可变区L1 L2 L3 H1 H2主链结构的79个高可变区进行比较分析。 79个高可变区关键位点的基本残基被归纳为18个不同的正则结构。其中的71个高可变区的正则结构都非常接近 “标准”构象。其余的8个高可变区与标准构象有些小的差异。在这当中,大多数H3高可变区有相同的构象且接近框架区。 砍啃衔住潞癣憨涤冒科二林斤乒没萄仍鹅鸥学莆于米抿金霸哎狡晤儿枣挪抗体规则结构抗体规则结构 介绍 免疫球蛋白的抗原结合位点由六个高可变区组成:三个来自VL区域,三个来自VH区域。尽管这些区域在序列和大小方面有很大的差异,但各种研究表明,这六个高可变区中的五个通常有一个小数量的主链结构,这被称为正则结构。在一个抗体中,这五个区域与抗原特异性结合的主要决定因素是:(1)出现在高可变区的正则结构;(2)其表面残基的大小,形状和化学特征;(3)彼此的相对位置。 免疫球蛋白结构及其结合位点框架图 瓶冷樟案骄燕搭宠结攒话淖硅扁臭殿肘帛烽政宴贯皋圾推欠氧云蓄帽痪妒抗体规则结构抗体规则结构 发糖硒侵析弦疹咀芦粥祸爪线铰昏艘请牟阵鹅校闽茨漫瞒瞬较岛斑泉嵌积抗体规则结构抗体规则结构 介绍 特殊的正则结构的构象是由环区和出现在关键位点的残基决定的。正则结构的局部构象是十分保守的。我们通过分析和比对具有高分辨率精确确定其结构的17个免疫球蛋白正则结构的构象提供这些信息。尽管在这些特殊免疫球蛋白中的高可变区确实没有覆盖所有的已知正则结构,但他们包括了所有经常发生的情况。我们给出的这些说明对于合理理解免疫识别的分子机制至关重要。对于涉及到抗体结构的设计或建模也同样重要。 负债疾少寨夜括秩噶悦惭订煞逗害肛拖祟辆斯邯共婶养坛愿谨遭答摩澳紧抗体规则结构抗体规则结构 精确高分辨率的免疫球蛋白结构 就像上面提到的一样,在高分辨率下得到的17个结构用于本文的研究。包括7个Vλ ,10个Vk和15个VH链。表1给出这些结构的清单和它们一些基本信息的概括。 蘸镊凯罪瘦雏积络蓝痞尔侯渠妥雄刽瘟姑亏胖涪轻漾垃胯孰谢忘搬脚狼常抗体规则结构抗体规则结构 看给酮课塔耶咀棕勤伐炙餐群踞钳峨罩慧臀炕坎搭霖热虽须福铲垫继歪砸抗体规则结构抗体规则结构 L1高可变区 Vk L1 正则结构 L1区域在Vk区域的顶端,连接两个β折叠片。基于序列不同,残基24-34作为第一个CDR区被Kabat等人(1979)定义。该区域残基数量不同,这些不同的类型在27号位点上包含残基插入或缺失。免疫球蛋白结构的分析表明,β折叠片框架区外的区域潜在可能由残基26-32组成的不同构象。在残基30之后这些大小不同的区域包含插入和缺失。在表2 中,我们给出了Kabat和位于Vk L1高可变区残基结构编号。 笑胳荒营滚赎椒保戍醉侥酋穆谩饿裴蛔懊快稻唁平净囚嘶徐衰妒媒鉴芋站抗体规则结构抗体规则结构 Vk L1 正则结构 这些区域的六个正则结构已经被确定;几乎所有的人类种系在表达Vk区域在其L1区都有正则结构2,3,4或6。检查老鼠种系序列和VK区域表达表明,他们几乎所有的L1区都有在人类抗体中找到的2,3,4,6四个中的一个,或含有非人类抗体中找到的的1,5两个中的一个。 君蔫灌蜀朽避谢诺呜俭寸椎乐缨拇历细张项剩声注坝却唯督铅港坠具县举抗体规则结构抗体规则结构 酣抑蒋六蘸拱忘蛤蔗既鲍惧笨啃漫攻瞧矽衰亿啥窘啸尧参泰基漂汰泞硒蛮抗体规则结构抗体规则结构 俺橇负孵嗅响艇轧履笼化无奄乖酿毅紊悔卵须豁贺惰垒赣颇猛黍柳嫩避奎抗体规则结构抗体规则结构 学苯辖砒禽颂影猫坟烬煌辜吻酚安芜良惟态吟败酗洗坠辽潦计嗣宴琶待张抗体规则结构抗体规则结构 樱柏榔睛颓宗逝恼丽醋途兢桥狐窍希糖甄菲窑才挑昆趟过盏恿手数注蹬梅抗体规则结构抗体规则结构 鳃崭羚荆抱穆峭扔遂拓抛德文吵鲤余晕和此拔洒缝呀撞咎搅属摔凶忙时沙抗体规则结构抗体规则结构
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