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东南大学生化王大勇第6章
Chapter 6: Protein structure and function 对于三维结构的理解是解析蛋白质如何行使其功能的基础。 球状蛋白质构象是柔性的、动态的。 动态的球状蛋白质如何在与其它分子的相互作用中行使他们的生物功能? Myoglobin and Hemoglobin Why are Hemoglobin and Myoglobin indispensable? Properties of oxygen Poorly soluble in aqueous solutions; Ineffective diffusion through tissues over distances greater than a few millimeters. Thus, larger, multicellular animals depended on proteins to transport and store oxygen. What’s the function of Myoglobin/Hemoglobin? Oxygen carriers Hemoglobin transport O2 from lungs to various tissues Myoglobin is an O2 storage protein Section 1: Structure and function of myoglobin 抹香鲸肌红蛋白(Myoglobin)的三级结构 空间位阻的意义:游离在溶液中的铁卟啉结合CO的能力比O2大25000倍,但在肌红蛋白中,仅比O2大250倍。原因是由于空间位阻造成的。这样可以防止代谢过程中产生的CO占据O2的结合部位。 疏水环境的意义:通常O2与Fe(Ⅱ)接触会使Fe(Ⅱ)氧化为Fe(Ⅲ),血红素也是一样。但在肌红蛋白内部,由于疏水的环境, Fe(Ⅱ)不易被氧化。 微环境的作用:固定血红素基;保护血红素铁免遭氧化;为O2提供一个合适的结合部位。 4. 02的结合改变肌红蛋白的构象 Conformation change after O2 binding to Heme group: F-helix “pulled” by O2 binding 5. 肌红蛋白结合氧的定量分析 Section 2: Structure and function of hemoglobin Abundant in red blood cells; adult: HbA: α2β2 98% HbA2: α2δ2 2% fetal: HbF α2γ2 1. 血红蛋白的结构 1.1 血红蛋白的亚基组成 血红蛋白有两种4个亚基组成 人在不同发育阶段血红蛋白亚基的种类是不相同。 血红蛋白的三维结构 图6-8 血红蛋白中亚基的排列 A 正面观 B 侧面观 Similar structure between Mb and Hb 血红蛋白α链和β链和肌红蛋白构象的相似性 2.1 氧合血红蛋白显著改变Hb的四级结构 图6-10 血红蛋白半分子(αβ二聚体的侧面观) 作为动态构象分子,血红蛋白可以看作是αβ-二聚体的二聚体,也可以看作是相同的二聚体半分子组成:α1β1-亚基和α2β2-亚基对。 每个αβ-二聚体作为钢体移动。当血红素基氧合时,分子的两个二聚体半分子彼此滑动。 2.2 Conformation change after O2 binding to Heme group F-helix “pulled” by O2 binding breaking intersubunit bonds 2.3 氧合血红蛋白和去氧血红蛋白代表不同的构象态 (1)T态(紧张态) 和氧的亲和力高,是去氧血红蛋白的形式。 (2)R态(松弛态)和氧的亲和力低,是氧合血红蛋白的形式。 氧与一个处于T态的亚基结合后,转变为R态。原因是稳定T 态的作用力被破坏。 The T-state to R-state transition Oxygen Binding Curves 肌红蛋白与血红蛋白的氧合曲线有何不同?试解释之 肌红蛋白为双曲线而血红蛋白为“S”型曲线; 这是因为: 肌红蛋白为单体蛋白,在氧分压较低时即易于与氧结合;并随氧分压的增加逐渐达饱和; 而血红蛋白为寡聚蛋白,在氧分压较低时难于与氧结合; 血红蛋白的一个亚基在结合氧之后,其构像发生改变,由于其寡聚蛋白的协同效应,影响到其他亚基构像也发生改变,由“紧张型”转变为易于与氧结合的“松弛型”; “松弛型”的
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