扬子鳄种群MHC II类B基因多态性分析和几种野生动物的分子鉴定.pdfVIP

扬子鳄种群 MHC II 类 B 基因多态性分析及 几种野生动物的分子鉴定 摘 要 为了研究扬子鳄（Alligator sinensis ）种群MHC 基因的多态性， 我们选取了安徽宣城野生扬子鳄种群、安徽省扬子鳄繁殖研究中心饲 养种群和浙江长兴饲养种群三个亚种群的 14 条扬子鳄，利用一对特 异性引物扩增出扬子鳄MHC II 类B 基因第三外显子的部分片段，并 对其进行了克隆、测序，结果从这些扬子鳄样本中共获得34 种不同 序列，每个亚种群内分别检测到 15，9 和 10 个不同序列。另外，第 三外显子核苷酸的非同义替换率显著小于同义替换率，可能暗示了扬 子鳄种群MHC II 类B 基因第三外显子的多态性不是由平衡选择保持 的。并且在这三个亚种群中都发现有相同的等位基因，例如等位基因 Alsi -29 和 Alsi -34 ，这可能表明这三个亚种群之间曾经发生过基因交 换。 另外，我们分别使用不同方法对梅花鹿和亳州市药品监督管理局 送检的三件猴骨样品（BZ01 、BZ02和BZ03 ）进行了分子鉴定。对于 梅花鹿的鉴定，我们运用了序列特异性扩增区域（Sequence Characterised Amplified Region，SCAR ）标记方法，使用100条随机引 物分析了皖南地区黑麂（Muntiacus crinifrons ）、黄麂（Muntiacus reevesi ）、梅花鹿（Cervus nippon kopschi ）和毛冠鹿（Elaphodus cephalophus ）等12个动物个体的随机扩增多态DNA （randomly amplified polymorphic DNA ，RAPD ），得到一条梅花鹿物种特异性扩 增片段。对该片段克隆、测序后，我们根据其序列设计出一对梅花鹿 特异性鉴定引物。通过这对引物的使用使得梅花鹿样品的鉴定更加容 易、快捷、可靠。而对于猴骨样品，我们则利用线粒体12S rRNA基 因和Cyt b基因部分序列，通过DNA序列比对的方法对其进行了鉴定。 结果表明，BZ01号样品为藏酋猴（Macaca thibetana ），BZ02和BZ03 号样品为猕猴（Macaca mulatta ）。另外，我们还发现，在利用DNA 序列比对法进行近缘物种的鉴定时，不同种群间的DNA序列变异， 可能对结果造成一定的影响。 关键词：扬子鳄，MHC基因，多态性，梅花鹿，SCAR，分子鉴定， 猴骨 I Polymorphism Analysis of MHC Class II B Gene in Chinese Alligator (Alligator sinensis) and Molecular Identification of several Wildlife Species Abstract We analyzed the polymorphism of MHC class II B gene in 14 Chinese alligators (Alligator sinensis) sampled from three different areas: the wild population of Xuancheng in Anhui, the captive population of Changxing in Zhejiang and the captive population of Anhui Research Center for Chinese Alligator Reproduction. The gene fragment was amplified using a pair of spe