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捷蜥蜴线粒体基因组及有鳞目系统发育研究 专业名称：生物化学与分子生物学 申请人： 陶春荣 指导教师：秦新民教授 论文答辩委员会 拂遗遮 -1飘殇。j— 委员：雨荻I、吣／VC／^、、 盏鱼聋 ’ 前男 刻聋壅 IIIII)HI)1)))b1))lHlll))lI IIIIII 捷蜥蜴线粒体基因组及有鳞目系统发育研究 研究生：陶春荣 年级：2011级导师：秦新民教授 学科专业：生物化学与分子生物学 研究方向：分子系统学 摘要 捷蜥蜴(Lacerta 动物，广泛分布在欧、亚、非洲，国内主要分布于新疆。该物种已经被收录到《国家保护 的有益的或者有重要经济、科学研究价值的陆生野生动物名录》。 rRNA和核基因 列进行了扩增和测序。从GenBank中下载39个有鳞目物种的线粒体16S c．mos序列，以奥利诺科鳄(Crocodylus 为外群，以16SrRNA基因序列及16S Inference，BI)和ML(Maximum (Bayesian 容和结论如下： 1．捷蜥蜴线粒体基因组全长17，090 rRNA rRNA和12S 形成茎环(stem．100p)结构。每个基因都没有出现基因重排的现象，而且它们在位置上、 顺序上和方向上都与大多数报道过的有鳞目的多数物种相同。捷蜥蜴线粒体基因组碱基组 捷蜥蜴线粒体基因组碱基表现出负GC偏斜值(。0．330)及正AT偏斜值(0．038)。 CO 2。捷蜥蜴线粒体基因组13个蛋白质编码基因中，NDl以ATT为起始密码子， I、COII、ND6 I和ND2则 ND4L、ND5、ND6、C灿6个基因以完全的吖蚺行使终止密码子功能，CO ND3、ND4 4个基因的终止密码子为不完全T。 21个tRNA基因的二级结构均呈典型的三叶草结构。 t．ACATn汀CCⅡ订T 的非编码区存在一些特殊序列：5’端有3个终止相关序列：TASl：5 保守序列： CSB．1： CSB．2：：5’． AAACGA．3’。 5．基于39个物种(不包括外群)16S rRNA基因和16S 分别构建了有鳞目的BI和ML系统发育树。结果表明：得到的4棵系统发育树拓扑结构 基本一致，6个亚目都表现出良好的单系性，鬣蜥亚目与蛇蜥亚目形成姐妹支后，与壁虎