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Protocol蛋白质纯化步骤
Protocol
蛋白质纯化方法(镍柱)
柱前操作
IPTG诱导后,收菌,8000rpm/min(r/m)离心10min;
用Binding Buffer(BB)溶解(每100ml原菌液加BB 20ml),超声裂解30min(工作:5s,停止:5s),1500r/m离心10min,去除杂质;
取上清,12000r/m离心20min, 得包涵体;
用含2M尿素的BB洗包涵体,12000r/m离心20min,(上清做电泳);???
用含6M尿素的BB溶解包涵体,12000r/m离心20min,(上清做电泳);
对照电泳结果,将上清或包涵体溶解液上柱;
平衡柱子(柱体积:V)
7. 3V(3倍柱体积)ddH2O(洗乙醇);
8. 5V Charge Buffer(CB); ???
9. 3V BB;
柱层析
上样;
10V Washing Buffer(WB);
6V Elute Buffer(EB);
分管收集,每管1~2ml.
各种缓冲液配方
1. 8×BB: 4M NaCl, 160mM Tris-HCl, 40mM imidazole(咪唑),pH=7.9
1000ml
NaCl: 58.44×4=233.76g
Tris-HCl: 121.14×160×10-3=19.3824g
Imidazole: 68.08×40×10-3=2.7232g
2. 8×CB: 400mM NiSO4
1000ml
NiSO4: 262.8×400×10-3=105.12g
3. 8×WB: 4M NaCl, 160mM Tris-HCl, 480mM imidazole, pH=7.9
1000ml
NaCl: 233.76g, Tris-HCl:19.3824g, Imidazole: 32.6784g
4. 4×EB: 2M NaCl, 80mM Tris-HCl, 4M imidazole, pH=7.9
1000ml
NaCl: 118.688g, Tris-HCl:9.6912g, Imidazole: 272.32g
5. 6M 尿素
1000ml
尿素:60.06×6=360.36g
Ni柱纯化蛋白注意事项
(2011-10-13 16:01:39)
使用Ni柱纯化带有His标签的融合蛋白,是我们大家再熟悉不过的实验操作了。我们对整个操作的流程及注意事项,很可能是师从兄师姐那里获得的。这些经验都是大家智慧的结晶。同时,这也有一定的不足之处,那就是我们学习到的是局部,还有一些我们不常用或者基本不会接触到的面儿,那些知识我们应该从哪里掌握呢?
给大家推荐一个办法,那就是参考那些大公司的实验手册。一般像GE、Qiagen等知名公司,都有Ni柱柱材料的产品,因此关于柱材料的各种性质参数,以及使用方法和注意事项都有详细的说明。
下面我就列举一些我从这些实验手册里总结出来的一部分Tips,仅供参考。
1. 避免缓冲液中有高浓度的电子供体基团,比如:NH4,甘氨酸,精氨酸,Tris,等等;2. 各种缓冲液中不能有强螯合剂,如EDTA,EGTA,等等;3. 各种缓冲液里不能有高浓度的强还原剂,,比如DTT,防止二价Ni被还原;4. 不能含离子型的去垢剂,比如SDS,防止Ni流失;5. 在破碎细胞的时候建议加入蛋白酶抑制剂,比如0.1-1mM的PMSF,防止目的蛋白被降解;
6. 缓冲液里可以加入甘油,防止蛋白之间由于疏水相互作用而发生聚集沉淀,甘油浓度最高可达50%(v/v)7. 应避免含碳酸氢钠,柠檬酸等物质;8. 缓冲液里NaCl的浓度应在300mM到2M之间;9. 可加入变性剂促溶,盐酸胍(最高可6M),尿素(最高可8M)10.可加入非离子型去垢剂,如Triton,Tween,NP40等,最高2%,可以减少背景蛋白污染和去除核酸污染;
一?非变性条件下抽提His-Tag蛋白质??? 下列方法适用于从细菌中抽提通常含有连续6个组氨酸尾(His Tag Protein) 的具有天然结构的可溶性重组蛋白质(Native Protein)。其他来源的蛋白质样品,如果目标蛋白质具有His-Tag结构,提供的层析方法可供参考。1) 准备细胞,接种,诱导表达。对于实验室用的pET载体表达系列,在细胞OD600=0.5-0.8时,用1mM IPTG诱导1-3小时,可以获得理想的表达效率。收集细胞,置于-70度或立即进行步骤2操作。2) 加入1/20细胞生长体积的NTA-0 Buffer(20mM Tris-HCl pH7.9,0.5M NaCl,10% Glycerol)和PMSF。PMSF用无水乙醇配制成200mM储存液,-20度或4度保存;PMSF使用的工作浓
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