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第五章第四节:植物数量性状qtl图位克隆方法
Backcross generation suitable to start the QTL fine mapping The advantages of the sequential QTL fine-mapping strategy To reduce experimental errors caused by both environmental factors and genetic background noise To increase progeny size to reveal the authentic genetic effect of a QTL To screen new recombinants in each generation to narrow down a QTL Diagram of genome reshuffling between 25 diverse founders and the common parent and the resulting 5000 immortal genotypes. Due to diminishing chances of recombination over short genetic distance and a given number of generations, the genomes of these recombinant inbred lines (RILs) are essentially mosaics of the founder genomes. ×, crossing; ?, selfing; SSD, single-seed descent. Allelic component and observed phenotype for founder lines of the NAM population. (A) Representative ear leaves from each founder inbred line and B73, the NAM reference parent. S. turcica, the causal agent of NLB, produces large cigar-shaped lesions that may coalesce, leading to complete blighting of the leaf in more susceptible inbred lines. (B) Heat map showing estimated allele effects for NLB resistance at 29 QTL identified in the NAM population for each founder inbred line. The large variation in the resistance phenotype results from the accumulation of alleles for resistance or susceptibility at multiple QTL in each founder line. Alleles for resistance are colored in red and alleles for susceptibility are in blue. The scale is shown on a square root transformation of percentage diseased leaf area. 植物数量性状位点(QTL)图位克隆 第五章第四节 数量性状变异的遗传基础 生物自然群体在形态、生理、行为和抗性等性状上存在极大的变异,表现为数量性状遗传。 数量性状涉及多个位点,每一位点的效应微小,存在等位基因的变异,等位基因的效应通过每个个体所处的环境表现出来。P=G+E+G×E 当前生物学的一个重大挑战是明确数量性状变异的遗传基础 数量性状位点 (QTL) Quantitative Trait Locus (QTL)是生物基因组上的某个区段,它含有一个或多个基因,影响数量性状的变异。 QTL可以通过多态性分子标记与性状的连锁关系而确定下来,即QTL定位。 QTL初定位 -查找QTL在基因组上的大概位置 初定位的群体:连锁群体和关联群体: 连锁群体:人工群体,利用杂交过程中产生的重组,通过分子标记多态性与性状变异的连锁关系定位QTL。 关联群体:自然群体,利用进化或育种过程中所积累的重组和变异,通过基因组中的连锁不平衡(LD)来确定遗传多态性与性
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