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第四章 基因操作过程 ;转化子的筛选和鉴定(检);;第一节 DNA的体外重组;亚克隆:把DNA片段从某一类型的载体无性克隆繁殖支另一类型的载体的过程。;理想的酶切位点应当符合下列几个条件; 外源DNA与载体的连接方法;1 黏性末端连接法;同种内切酶生产的粘性末端的连接;同尾酶生产的粘性末端的连接;单酶切位点黏性末端连接法的缺点;双酶切片段的定向克隆;双酶切片段的定向克隆的优点;不同粘性末端的连接;从分子动力学的角度讲,由限制性核酸内切酶创造的粘性末端的连接属于分子内部的连接,而平头末端的连接则属于分子间的连接,因此后者反应速度要慢得多
提高平头末端连接效率的方法包括: ;平末端的连接的优点;3 人工接头连接法;粘性末端的更换;4 同聚物加尾(homopolymer tails joining)连接法;人工粘性末端的连接 5′突出末端;人工粘性末端的连接 3′突出末端;人工粘性末端的连接 平头末端;同聚物接尾法实际上是一种人工粘性末端连接法
主要优点;5 重组率;提高重组率的方法;提高重组率的方法;第二节 重组体导入;1 用于基因转移的受体菌或细胞;1.1 受体细胞应具备的条件;1.2 各种基因工程受体的特性;枯草杆菌;链霉菌;酵母菌;昆虫细胞(家蚕);哺乳动物细胞(中国仓鼠卵巢细胞 CHO) ;植物细胞(拟南芥、烟叶) ;拟南芥(Arabidopsis thaliana);拟南芥是进行遗传学研究的好材料
被科学家誉为“植物中的果蝇”;1.3 实验室常用的基因工程受体;克隆与导入方法:
转化:将重组质粒导入受体细菌细胞,使受体菌细胞遗传性状发生改变
转染:携带外源基因的病毒感染受体细胞的方法
电转化:受体细胞施加短暂的高压电流,其质膜上形成微孔,外源DNA通过微孔进入宿主细胞
基因枪法:利用压缩气体动力,产生的冷气体冲击波进入轰击室,把粘有DNA的金粉打向细胞核。
微注射法:将外源基因直接注射到真核受体细胞内转化酵母菌
植物细胞的叶盘法基因转移;2.1 转化(transformation);pUC18质粒 ;用接种环直接取冻存的大肠杆菌DH5α,在LB培养基平板表面划线,于37℃培养16小时 ;挑取一个单菌落,转到3-5mlLB培养基中,于37℃培养3-5小时 ;加入0.2ml预冷的0.1mol/l CaCl2,悬浮沉淀,即可使用。
也可加入总体积15%的甘油 可-70℃长期保存 ;外源DNA的转化;37℃培养9~16h;利用成品感受态细菌转化;在Selektionsplatten (LB/Amp/IPTG/X-Gal)?上生长的是转化子;同时做两个对照:;以同体积的无菌双蒸水代替DNA溶液,但涂板时只取5μl 菌液涂布于不含抗生素的LB平板上,此组正常情况下应产生大量菌落; ②电穿孔转化;将细菌溶于1~2ml 10%的甘油中,以40~80μl/管分装
-70℃冻存,备用;将脉冲电击转化仪打开,调电压为1.8KV
从-70℃取出保存的感受态细胞,解冻后置于冰上
每管感受态细胞加入1μl 连接产物,转移到电击杯中
电击,然后迅速向电击杯中加入1ml液体LB培养基
将电击后的菌液转移至1.5ml Eppendorf管, 37℃恒温摇床培养1h
铺100μl于含X-gal和IPTG的Amp平板
37℃恒温培养箱培养9-16h
;2510电转仪,适用于原核细胞;In vitro packaging and transfection;l噬菌体DNA的转染;3 转化率;如:pUC18对大肠杆菌的转化率为108,即每微克pUC18中只有108个分子能进入受体细胞。一微克pUC18共有3.4×1011个分子(6.02×1017 / 2686×660),即每3400个pUC18分子才有一个分子进入受体细胞
另一方面,在实际操作过程中,转化一微克pUC18共需2ml感受态细胞,大约含有2×1010个大肠杆菌细胞,也就是说,每200个细胞只有一个细胞能接纳pUC18 DNA ;转化率的用途;转化率的影响因素;受体细胞方面: ;转化方法方面: ;4 转化细胞的扩增;扩增操作;第三节 重组子的筛选; 由于重组率和转化率不可能达到理想极限,因此必须借助各种筛选和鉴定方法区分转化子与非转化子、重组子与非重组子、目的重组子与非目的重组子;1 遗传检测法;抗药性筛选法;抗药性筛选法;显色筛选法;1.2 营养缺陷型筛选法;常见的营养缺陷型筛选标记: ;2 依赖重组子结构特征的筛选法;② 限制性酶切图谱法;3 核酸杂交法;3.1 探针及制备 ;寡核苷酸探针(oligonucleotid probe):是人工合成且被适当标记的由短链核苷酸组成的大分子(即一段比较短的DNA或RNA),能与被检测长链DNA或RNA进行分子杂交,且杂交后
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