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武汉大学2007—2008学年度 高校教师研修班 《生物信息学》试卷（B）及答案 翻译下列名词并解释。 (每题5分，共25分) 1. HGP 2. SRS 3. Markov Chain 4. ANN 5. CDS 二、填空(每空2分，共20分) 1、生物信息学主要研究的两种信息载体是 和 。 2、目前国际上主要的核酸数据库是由 建立和维护的 、由 维护的 ，和日本遗传研究所建立和维护的 。每个机构负责收集来自不同地理分布的数据， 3 个数据库 所有信息并向世界开放， 3、 在进行序列两两比对时，有两方面问题直接影响相似性分值： 和 。 三、解释说明：请按要求对下列GenBank文件作解释说明。(每小题4分，共20分) 1、LOCUS行中的第3项mRNA linear表示 ，这里是 。 2、DEFINITION行在GenBank记录中用以 3 ACCESSION 是 ，是从数据库中检索一个记录的主要 。 4. FEATURES后面部分是 ，直接表达了记录的生物背景知识， 5 CDS 30…533 表示 。 四、问答。（共35分） 1、DNA测序有哪些方法？其基本原理是什么？（10分） 2、简述蛋白质结构预测的基本思想和方法。（10分） 3、试述人类基因组计划与生物信息学的关系。（15分） 《生物信息学》试卷（B）答案 翻译下列名词并解释。 (每题5分，共25分) 1. HGP Human genome project人类基因组计划 2. SRS Sequence Retrieval System 序列检索系统 3. 马尔科夫链（Markov Chain），对于生物分子序列分析，马尔科夫链是一个很好的数学统计模型，因为马尔科夫链本身就是相继发生事件的序列，其特征是对于事件序列中的任何一个事件都有一个发生概率，而这个概率依赖于该事件之前的若干个事件。 4. ANN Artificial Neural Network, 人工神经网络 5. CDS指的是编码序列,从起始密码子到终止密码子 二、填空(每空2分，共20分) 1、生物信息学主要研究的两种信息载体是DNA分子和蛋白质分子 2、目前国际上主要的核酸数据库是由美国国立生物技术信息中心建立和维护的Genbank库、由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护的EMBL-Bank，和日本遗传研究所建立和维护的日本DNA数据仓库(DDBJ)。每个机构负责收集来自不同地理分布的数据， 3 个数据库共同享有所有信息并向世界开放， 3、 在进行序列两两比对时，有两方面问题直接影响相似性分值：取代矩阵和空位罚分。 三、解释说明：请按要求对下列GenBank文件作解释说明。(每小题4分，共20分) 1、LOCUS行中的第3项mRNA linear表示生物分子的类型，这里是单链的mRNA。 2、DEFINITION行在GenBank记录中用以总结记录的生物意义 3 ACCESSION 是检索号，是从数据库中检索一个记录的主要关键词。 4. FEATURES后面部分是特性表，直接表达了记录的生物背景知识， 5 CDS 30…533 表示编码序列是从序列的第30个核苷酸到第533个核苷酸的连续序列 四、问答。（共35分） 1．DNA测序有哪些方法？其基本原理是什么？（10分） 答： ①链终止法测序.基本原理: 通过合成与单链DNA互补的多核苷酸链,由于合成的互补链可在不同位置随机终止反应,产生只差一个核苷酸的DNA分子,从而来读取待测DNA分子的顺序. ②Maxam Gilbert DNA化学降解法，基本原理:在选定的核苷酸碱基中引入化学集团,再用化合物处理,使DNA分子在被修饰的位置降解. ③自动化测序，基本原理：与链终止法相同，只是用不同的荧光色彩标记ddNTP,，由于每种ddNTP带有各自特定的荧光颜色，而简化为由1个用刀同时判读4种碱基。 ④非常规DNA测序，如DNA芯片测序，基本原理：将各种排列顺序的寡核苷酸点播在芯片上, 每个点播的寡核苷酸在排列的方阵中都有指定的位置.待检测的DNA分子与芯片温浴,凡是能杂交的寡核苷酸都会在确定位置发出信号,然后根据获取的信息将寡核苷酸的顺序进行对比组装,拼接成完全的DNA顺序. 2简述蛋白质结构预测的基本思想和方法。