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SRAP-RAPD实验操作流程
SRAP-RAPD实验操作流程
1酶类及试剂
Taq DNA聚合酶为大连宝生物工程公司产品;
蛋白酶K为Merk公司产品;
T4DNA连接酶为Promega公司产品。
Wizard DNA Clean-up System、WizardTM PCR Preps DNA Purification System为Promega公司产品;小量基因组DNA抽提试剂盒、UNIQ-10柱式PCR产物纯化试剂盒为上海生物工程公司产品。
DL-2000 DNA Size marker为大连宝生物工程公司产品,100bp DNA Size marker由广州普博馈赠。
2培养基
LB液体培养基:胰蛋白胨10g,酵母提取物5g,氯化钠10g,加800mL去离子水充分溶解,用1mol/L的氢氧化钠溶液调整pH为7.2~7.4,加去离子水定容至1000mL,分装后15磅高压蒸汽灭菌15~20min,4℃保存备用。
LB固体培养基:于LB液体培养基中加1.6%的琼脂粉,15磅高压蒸汽灭菌15~20min,待其冷却至70℃左右时倒板,凝固后4℃保存备用。
LB选择培养基:在LB液体培养基中加1.6%的琼脂粉,15磅高压蒸汽灭菌15~20min,待其冷却至50℃左右时,加入氨苄青霉素(Amp)(终浓度1000IU/ mL)轻轻摇动使其混合均匀,迅速分装至无菌平皿,室温凝固后4℃保存备用。
按分子克隆实验指南(第三版)(萨姆布鲁克等,2002)介绍的方法进行。
(1)Tris-Cl(pH8.0)
Tris碱 121.1g
浓盐酸 42mL
加去离子水定容至1000mL
(2)TE缓冲液(pH8.0)
10mol/L Tris-Cl(pH8.0) 1μL
0.5M EDTA(pH8.0) 0.2μL
加无菌去离子水定容至100ml,混匀,分装后经高压灭菌,4℃保存。
(3)5×TBE缓冲液
Tris 54g
硼酸 27.5g
EDTA 3.72g
加去离子水定容至1000mL
(4)10×TBE缓冲液
Tris 54g
硼酸 27.5g
EDTA(0.25mol/L) 80μL
加去离子水定容至500mL
(5)X-gal液(20mg/mL)
X-gal 0.08g
二甲基甲酰胺 4mL
充分溶解混匀,分装于1.5mL灭菌消毒的Eppendorf管中,用锡箔纸包裹以避光,-20℃保存。
(6)IPTG液
IPTG 0.6g
去离子水 3mL
充分溶解混匀,用0.25μm孔径的细菌滤器过滤,分装于1.5mL灭菌消毒的Eppendorf管中,-20℃保存。
(7)SDS裂解液
500mM NaCl 70μL
100mM Tris-Cl(pH8.0) 30μL
50mM EDTA(pH8.0) 150μL
10%SDS 30μL
(8)70%乙醇
无水乙醇 30ml
灭菌双蒸水 70ml
(9)封底用1%琼脂糖
琼脂糖 1g
去离子水 100ml
(10)40%丙烯酰胺液
丙烯酰胺 38g
Bis 2g
去离子水 100ml
装于棕色瓶中,4℃保存。
(11)10%AMP
过硫酸铵 1g
去离子水 10ml
(12)0.1%银染液
硝酸银 0.5g
去离子水 500ml
装于棕色瓶中,室温保存。
(13)显影液
NaOH 15g
硼酸
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