表达谱芯片数据分析基本思路.PDFVIP

表达谱芯片数据分析基本思路 张晓娜 产品经理 xiaona_zhang@ 表达谱芯片数据分析流程(两组） 表达谱芯片数据分析流程(多组） 功能分析及网络———IPA 引用超过15000篇（～2014 ） • IPA （Ingenuity Pathway Anaylsis ）是一个基于Web的分 析件。包括人工阅读提取的两百多万条公开发表的科研成果 和报告。可分析RNA-seq ，microRNA-seq ，芯片包括 miRNA和SNP ，代谢组学，蛋白质组学，和小规模的实验， 产生基因和化学药品列表。强大的分析和搜索工具的意义数 据，并确定新的靶标或者候选生物标志物。 IPA 详细介绍：/products/ipa#features Comparison Analysis Quickly visualize trends and similarities across analyses using heat maps for Canonical Pathway, Downstream Effects, Upstream regulators and Causal Network Analyses. Prioritize by score, hierarchical cluster or trend. 基因调控关系网络图 疾病与功能基因关系网络图 上游调控因子预测 各类信号通路、分子相互作用网路图构建 KRAS sub network 非小细胞肺癌 （NSCLC ）是肺癌 最常见的类型。 KRAS突变在 NSCLC中广泛存在， 但确无法成为现有 方法的药物靶点。 Three of the 27 genes are the target of known FDA- approved drugs (RAF1, PPARG, and TNFRSF10B). 用我们的平台，加速您的研究！