使用 TANSFAC数据库查询特定转录因子已知结合位点.docVIP

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2017-08-20 发布于河南
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使用 TANSFAC数据库查询特定转录因子已知结合位点.doc

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使用 TANSFAC数据库查询特定转录因子已知结合位点

使用 TANSFAC数据库查询特定转录因子已知的结合位点 TANSFAC是德国生物工程研究所开发的真核生物基因调控转录因子数据库，是当今世界上最大的转录因子数据库，包括顺式元件、基因、转录因子、细胞来源、分类和调控位点核甘酸分布6个子库。TANSFAC 5.4版本收录有4774种转录因子蛋白信息，结合位点信息11537个，以及相关基因1928个，参考文献9095条，对于顺式元件的分析功能非常强大。现在的版本TANSFAC 6.0应该包含更多信息。 1.其主页： HYPERLINK 。进入主页后先注册,登录。点击TANSFAC进入数据库。 2.点击SEARCH,进入SEARCH页后点击factor 3.选择factor name,输入待查转录因子名称，例如：sp1 4．点击人类的sp1 5.进入sp1的页面，点击BS，点击sp1下游基因的GENE accession no，如G000193 BS条目解释为Binding SITE G000193的页面