qtl图谱分析遗传图谱构建基因定位分子标记技术路线.ppt

现代分子生物技术 在优质肉鸡育种中的应用 常规育种技术 分子生物技术 分子标记辅助育种 标记辅助选择的意义 可直接选择基因型 呈等显性，可将杂合子与纯合子区分 可在两种性别任何年龄的个体检测 早期选择，加快选育进展 可阐明家系内遗传变异 对限性性状和年龄限性性状最为有利 标记辅助育种原理 举例说明 前期研究进展 利用分子标记研究： 地方鸡种遗传变异及遗传多样性研究 标记与产蛋性能及蛋品质等相关研究 标记与生长发育及料肉比等相关研究 研究表明： 各分子标记星座位上各等位基因的基因频率在不同的群体间有比较明显的差异，出现一些特定的等位基因。 不同分子标记座位所反映的群体杂合度具有较大的差异，具有较大选育潜力。 四川不同地方鸡种群有较大遗传差异，表现出不同的遗传距离。 与性状相关的分子标记 肉用性状： 体重、日增重、相对－绝对增重、屠宰性能、料肉比等 蛋用性状： 开产日龄、开产蛋重、开产体重、300日龄产蛋量，月产蛋量、蛋品质性状等 * 朱 庆 （四川农业大学 教授、博导） 表现型 外 观 生长发育 产蛋性能 数量遗传分析 纯繁 杂交 新品种选育 本身成绩 同胞成绩 后裔成绩 基因型 分子标记 基因定位 性状连锁 辅助选择 分子遗传标记－DNA标记 特 点： 数量大 遗传稳定，不受环境影响 呈等显性或完全显性 标 记： RFLP, RAPD, VNTR, AFLP, mtDNA 等 家禽经济性状－数量性状 数量性状基因座 （QTL） QTL图谱分析 遗传图谱构建 基因定位 分子标记 技术路线： 寻找QTL的染色体片断 标定QTL位置 找到与QTL连锁的标记 寻找候选基因 与性状相关的特定基因 特定基因的功能位点 标记辅助选择 Southern杂交 利用载体 基因文库 阳性克隆 选择引物 作序列分析 微卫星DNA探针（CA）n PAGE检测 PCR扩增 微卫星检测： 标记性状相关分析： 分子标记 （标记基因座分析 ） 基因型 （最小二乘分析） 性状 （方差分析检验） 相关分析 功能基因定位克隆： 确定基因在染色体上的大致位置 （家系连锁分析资料） 获得目的基因DNA片段 突变检测验证和功能分析 （染色体步移等技术） 绘制染色体图谱 （筛选目的基因） 确定含有候选基因的染色体片段 种 染色体数 连锁图上的遗传标记总数 微卫星标记数 物理图上基因数 连锁群数 基因组大小(cM) 覆盖比例(%) 牛(Cattle) 2n 60 2100 1500 608 31 2900 95 绵羊(Sheep) 2n 54 1040 895 105 27 3400 95 山羊(Goat) 2n 60 337 307 202 ? 2740 88 猪(Pig) 2n 38 1800 1400 400 19 2200 95 马(Horse) 2n 64 240 200 10/20* 19/25* 936/679* ? 鸡（Chicken） 2n 78 1727 800 191 51 3800 95 人(Humans) 2n 46 ? ? ? ? ? ? 小鼠(Mouse) 2n 40 26470 ? 10487 21 1450 100 鼠（Rat） 2n 42 ? 9000 1300 21 2000 100 狗（Dog） 2n 78 210 200 ? 41 ? ? 鹿（Deer） 2n 68 230 66 164 34 ? ? 几种重要畜禽种和人类及家鼠基因组有关数据 家禽染色体标记图谱 —— 优质鸡肉质性状选育 根据研