- 1、本文档共5页,可阅读全部内容。
- 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
表达抑制后活化淋巴细胞基因表达谱变化分析向莉李鹏张竹君杨明珍陈安胡川闽重庆第三军医大学医学检验系临床生化教研室摘要目的利用全基因组寡核苷酸芯片检测干扰素调节因子结合蛋白后淋巴细胞基因表达谱的差异方法采用本室构建的表达抑制的细胞及相应对照细胞为对象处理细胞后提取刺激的细胞利用北京博奥生物有限公司芯片检测基因表达的差异以软件结合等生物信息学数据库检索分析差异表达基因功能和网络关系结果基因表达抑制的细胞在信号刺激后细胞能量代谢周期生长转录调控及凋亡等多种类型的基因发生差异表达改变时相组共有个差异表达趋
IBP表达抑制后活化T淋巴细胞基因表达谱变化分析
向 莉,李 鹏,张竹君,杨明珍,陈 安,胡川闽 (400038重庆,第三军医大学医学检验系临床生化教研室)[摘要] 目的 利用全基因组寡核苷酸芯片检测干扰素调节因子4结合蛋白(IRF-4 binding protein,IBP)后T淋巴细胞基因表达谱的差异。方法 采用本室构建的IBP表达抑制的Jurkat细胞及相应对照细胞为对象,Anti-CD3、CD28 mAb处理细胞后提取刺激2448 h的细胞RNA,利用北京博奥生物有限公司22K Human Genome Array芯片检测基因表达的差异以MAS.doc.V1软件,结合KEGG、NCBI等生物信息学数据库检索分析差异表达基因功能和网络关系。结果IBP基因表达抑制的Jurkat细胞在TCR信号刺激2448 h后,细胞能量代谢、周期生长、转录调控及凋亡等多种类型的基因发生差异表达改变,时相组共有56个差异表达趋势一致基因,其中个基因共同上调,个基因共同下调。结论在Jurkat T细胞IBP表达抑制所致多个基因差异表达。[关键词]干扰素调节因子4结合蛋白;T淋巴细胞;基因芯片[中图分类号]R392. 11 [文献标码]A
Gene expression profile of activated T lymphocyte with IBP deficient by oligonucleotide microarray
Xiang Li, Li Peng, Zhang zhujun, Yang mingzhen, Chen an, Hu Chuanmin (Department of Clinical Biochemistry, College of Medical LaboratoryThird Military Medical University, Chongqing , 400038, China)
[Abstract] Objective To investigate the difference of gene expression between activated IBP-deficient and wild T lymphocyte by oligonucleotide microarray and provide basis for further studying the role of IBP in T lymphocyte activation. Methods Total RNA was isolated from IBP-deficient and its parental jurkat T cells with anti-CD3 and anti-CD28 mAb stimulation, and synthesized into double-stranded cDNA that was then synthesized into biotin-labeled cRNA probe by in vitro transcription. The cRNA probes were separately hybridized with 22K Human Genome Array Chip, and the signals were scanned by the GeneArray Scanner. The results were analyzed by bioinformatics. Results In comparison with the gene expression profile of parental Jurkat T cells, 17 genes were up-regulated and 39 genes down-regulated in activated IBP-deficient Jurkat T cells. According to Gene Ontology and Tree View analysis, these genes were involved in energy metabolism, cell cycle, transcription and apoptosis and so on. Conclusion Many differential expression genes induced by the lost of IBP in Jurkat T cells have been screened by high-throughput gene chip method. Validating their mo
您可能关注的文档
- 国家科举与家族以明代宁波杨氏为中心的考察钱茂伟研究缘起明代.doc
- 国家食源性疾病监测与报告信息系统实施方案-四川卫生和计划生育.doc
- 国家卫生计生委临床检验中心室间质量评价标准-重庆临床检验中心.doc
- 国家物资储备局深圳办事处2017年事业单位公开招聘调剂岗位面试.doc
- 国立北港高级农工职业学校100学年第2学期.doc
- 国军人员101年体检报告表.doc
- 国立空中大学97学年下学期期中考试题【正参】58.doc
- 国立台东高中99学年第一学期高三期末考生物试卷适用班级1.doc
- 国立阳明大学授课进度表管理系统-国立阳明大学公共卫生研究所.doc
- 国立宜兰高商九十六学年第二学期高一护理与健康期末考试卷.doc
- 2024年中国钽材市场调查研究报告.docx
- 2024年中国不锈钢清洗车市场调查研究报告.docx
- 2024年中国分类垃圾箱市场调查研究报告.docx
- 2024年中国水气电磁阀市场调查研究报告.docx
- 2024年中国绿藻片市场调查研究报告.docx
- 2010-2023历年初中毕业升学考试(青海西宁卷)数学(带解析).docx
- 2010-2023历年福建厦门高一下学期质量检测地理卷.docx
- 2010-2023历年初中数学单元提优测试卷公式法(带解析).docx
- 2010-2023历年初中毕业升学考试(山东德州卷)化学(带解析).docx
- 2010-2023历年初中毕业升学考试(四川省泸州卷)化学(带解析).docx
文档评论(0)