重复片段PCR检测葡萄球菌DNA指纹在医院感染中的分析.PDFVIP

5·14 · Chin J Nosocomiol Vol. 13 No. 6 2003 ·论 　著· 重复片段 PCR 检测葡萄球菌 DNA 指纹 在医院感染中的分析 王海燕 , 梁 　慧 , 崔云龙 , 张丽萍 , 刘元明 , 韩 　彬 (武警总医院 ,北京 100039) ( ) 摘要 : 目的 　应用重复片段 PCR ,对凝固酶阴性葡萄球菌 CNS 进行基因分型 ,用于医院感染中分子流行病学研 ( ) 究。方法 　选择 REP1 + REP2 和 ERIC1 + ERIC2 两对引物 ,对临床分离的 68 株 CNS 菌株进行重复片段 PCR , 根据扩增产物的电泳模式编制菌株间的相似矩阵 ,并利用 RAPD 、PHYL IP 及 TREEV IEW 等软件 ,绘制各株间的 遗传聚类图。结果 　两对引物的扩增带型均比较丰富 ,对于实验 CNS 菌株具有较好的分辨率 ,根据聚类结果 ,可 以确定某些菌株之间的同源性,为感染源的确认等分子流行病学研究提供依据。结论 　重复片段 PCR 分辨率 高 ,根据聚类结果确定菌株的同源性 ,为医院感染确认感染源提供了分子流行病学的依据。 关键词 : 医院感染 ; 重复片段 PCR ; 凝固酶阴性葡萄球菌 中图分类号: R378. 1 + 1 　　文献标识码 : A 　　文章编号 : (2003) Repetitive Element Sequencebased PCR Fingerprinting of Coagulasenegative Staphylococci for Hospital Infection Research WAN G Haiyan , L IAN G Hui , CU I Yunlong , ZHAN G Liping , L IU Yuanming , HAN Bin ( General Hospital , China People ′s A rmed Police Forces , Beijin g 100039 , China) Abstract : OBJECTIVE To have a molecular epidemiologic investigation of hospital infection by performing genotyping of coagulasenegative staphylococci (CNS) using repetitive element sequencebased PCR. METHODS DNA templates from 68 CNS clinical isolates were amplified by primers , REP1 + REP2 and ERIC1 + ERIC2 ; and the similarity matrix was calculated from electrophoresis patterns. Dendrograph of isolates was obtained by RAPD , PHYL YP and TREEV IEW softwares. RESULTS The CNS strains were amplified by both primers. With adequate bands the homology of the s