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样本寄送指引-青莲百奥
青莲百奥样品收集和寄送指南
寄送标准
寄送温度
胶条样品:冰袋环境;
组织、菌体、细胞沉淀、血清、培养基上清和蛋白提取液:样品收集好后立即置于液氮中冷冻5 min,-80℃保存,所有样品收集好后干冰环境寄送;
细胞:冻存细胞干冰寄送;培养中的细胞需保证状态良好,培养瓶中装满培养基,常温寄送;
寄送样品时附上填写完整的纸质版样品信息单(务必包含样品物种拉丁名及数据库、样品标识名称,管数,分组对比信息)。
样品标记清晰明确,与样品信息单中保持一致,不同项目的样品量参考如下所述
蛋白混合物鉴定
优先考虑客户提供考马斯亮蓝染色有明显条带的胶条样品,如银染样品则不能用戊二醛染色。建议上样量为20 ng~2 μg,保证全部蛋白都跑进分离胶,严格沿染色条带大小切下蛋白样品装入1.5mL EP管中,一般不要超过1 cm2,不要切取没蛋白条带的多余胶。
客户若只能提供IP洗脱液,则属于非常规项目要进行额外处理,需提供IP洗脱液成分的详细信息,项目周期延长1周。
单蛋白修饰鉴定
优先考虑客户提供考马斯亮蓝染色有明显条带的胶条样品,且单蛋白纯度为80%以上。
单蛋白泛素化修饰鉴定,切取目的蛋白和目的蛋白以上至浓缩胶的全部分离胶作为样品;如是抗体纯化的单蛋白,则需将抗体重链和轻链去除。
客户若只能提供IP洗脱液,则属于非常规项目要进行额外处理,项目周期延长1周,需提供IP洗脱液成分的详细信息和目的蛋白分子量,需提供WB验证后的蛋白实际分子量。
iTRAQ/TMT/二甲基标记定量蛋白质组学
最好送原始样本,除非客户有成熟的蛋白质组学的蛋白提取方法。
动物组织样品:湿重不少于200 mg,样品不能溶血,取材后用PBS冲洗3遍去除血液污染。
植物组织样品:湿重不少于1 g,取材后用PBS冲洗3遍去除杂质污染。
菌体样品:原则上只接受常见无毒菌的菌体样品,菌体沉淀不少于100 mg或者体积不少于100 μL;若为含有毒菌的菌体样品或菌体裂解液,按照《病原微生物技术服务操作指南》执行。
细胞样品:收集细胞沉淀,PBS冲洗3遍,送样量为5×106或细胞沉淀不少于50 μL。
培养基上清液:需保证无菌体或细胞(用0.2 μm膜过滤),有条件可浓缩后再寄送;送样体积不少于10 ml。
血清样品:新鲜血液取出后,4℃,2000 g,离心15 min,取上清,即得血清;血清制备过程中保证不能溶血;血清体积要求不少于500 μl;制备血清过程中,客户可根据自己的样品和实验要求选择是否添加抗凝剂,一般不用添加。
若客户直接提供蛋白,则蛋白量不少于1 mg,浓度不低于2 mg/mL。
SILAC定量蛋白质组学
客户提供的细胞系使用的培养基需符合公司现有SILAC培养基类型: 1640/DMEM/MEM;若非这三类培养基的细胞系,需提前查阅是市面是否有SILAC培养基。
客户可自行提供细胞系:冻存细胞干冰环境寄送;状态良好的在养细胞,培养瓶中装满培养基,常温寄送。
如客户自己培养的细胞:需做好标记效率检测,收集细胞沉淀,PBS冲洗3遍,送样量为5×106或细胞沉淀不少于50 μL。
若客户直接提供蛋白,则蛋白量不少于1 mg,浓度不低于2 mg/mL。
定性修饰组学
最好送原始样本,除非客户有成熟的蛋白质组学的蛋白提取方法。
动物组织样品:湿重不少于500 mg,样品不能溶血,取材后用PBS冲洗3遍去除血液。
植物组织样品:湿重不少于5 g,取材后用PBS冲洗3遍去除杂质污染。
菌体样品:原则上只接受常见无毒菌的菌体样品,菌体沉淀不少于1 g或者体积不少于500 μL;若为含有毒菌的菌体样品或菌体裂解液,按照《病原微生物技术服务操作指南》执行。
细胞样品:收集细胞沉淀,PBS冲洗3遍,送样量为5×107或细胞沉淀不少于500 μL,磷酸化修饰定量送样量为2×107或细胞沉淀不少于200 μL。
若客户直接提供蛋白,则蛋白量不少于20 mg,组蛋白不少于 mg,尽量提供蛋白干粉,磷酸化修饰蛋白量为不少于10 mg,浓度不低于2 mg/mL。
iTRAQ/TMT/二甲基标记修饰定量组学
最好送原始样本,除非客户有成熟的蛋白质组学的蛋白提取方法。
动物组织样品:湿重不少于500 mg,样品不能溶血,取材后用PBS冲洗3遍去除血液。
植物组织样品:湿重不少于2 g,取材后用PBS冲洗3遍去除杂质污染。
菌体样品:原则上只接受常见无毒菌的菌体样品,菌体沉淀不少于300 mg或者体积不少于300 μL;若为含有毒菌的菌体样品或菌体裂解液,按照《病原微生物技术服务操作指南》执行。
细胞样品:收集细胞沉淀,PBS冲洗3遍,送样量为5×107或细胞沉淀不少于500 μL;磷酸化修饰定量送样量为2×107或细胞沉淀不少于200 μL。
若客户直接提供蛋白,则蛋白量不少于5 mg,组蛋白不少于 mg
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