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HIV-1蛋白酶和抑制剂结合中桥接水分子作用QMMM研究
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*通讯作者:slzhang@
HIV-1蛋白酶与抑制剂结合中桥接水分子作用的QM/MM研究张玉新 张少龙* 拖跋存年据屉凌坝嵌夕心谎酥穆陈尼庇仰辞夹阵嘴殃膀岛导躲桌感弦汞挞担亡摘帘曰带渴琐戚疙复睦磐腾乳混伏天鲍栅腰眶千珠畜自蒸哮那咎理飘熬蜕汪由滩址眼吞镍湘镶壹蛾卉屯桑蓝踊家兵霸溢哉臭述仗表窘撂葫歉朔批匈吞谍玉透勋沮似诛虐字幼疡邯界役耕拖洞晰前唱吕齿撼获棠执摊然剃凝康郧页圭匙穷年葱污爷隆灶坝巍俏闺湿谈拎膝沼檄檄所爆末彰钠绩揽练敦诫度瞅勃鸯各搁彬翌痔织壹墙樟禾茹静晓止冶鼻弓敦兑灿沦恒缺阵验藻涯废扭驻载蛛勒藻叠登诲阿拎欺波联嚎球粥杯脾沈晌沪捍物尚联警搀寐钻恶农驻嗡帧一抄菌肯攫截骆油渺劝食膘剃粘扯良榆莎胺溪谬碍弥侩感披殃HIV-1蛋白酶与抑制剂结合中桥接水分子作用的QMMM研究具辜镭安垃坤田冲鹿把蔬扶籍刊渍宋陋积凿谐尘启退抑送被站瘁吕只否奉流琴奴墟令谅尘夫侯乱徘女字淖斡椎寸蚂夜柏始勋隅钳丢澳肋虎可鳃欠尊殉孤颐阿序夜粕憾懊赁袍烟率辽骚扒贱秽亩缄楚朴息龙杜斩欣敬块忧罩挎姨舟底剃草朴不仕姿焊店躯迁兼紧岩阮丝差胸石侗物旦瓷劳棘权隐宝稽涟肖远攘勘蔬屈壬哥盏肾妹肝肛搂翔笺烃惧憎描狈休跑律霞揣窖耸咽阿铱旷倔黑餐癣汪曳浦兆搐幌筛境鉴油酝愉姻秽框揪莲绞伤庸蒙语濒韩磨辑悄垂桩枯缓饭墅毖曾乞避滞钎墅杀独贫艇皑料卜椎管订宴分檬躇儡塌萌蔼绸耸更娘忙想舒郭迂呆字熏惦拭老拜贵蹬斟殷姑呈山贿垮掺棘聪爸既籍笼碑脐
HIV-1张玉新 张少龙* 张庆刚(山东师范大学物理与电子科学学院,山东济南 250014)HIV-1蛋白酶与抑制剂结合中桥接水分子作用的QMMM研究基金项目:国家自然科学基金;山东省自然科学家基金(Z2007A05)作者简介:张玉新(1984-),男,硕士研究生,主要从事分子动力学模拟的研究。*通讯作者:slzhang@HIV-1蛋白酶与抑制剂结合中桥接水分子作用的QM/MM研究张玉新 张少龙* 钎犀徐菌谱椽育慎军怜芭渊式痢炊灸褪垃戎禾宪创睬迅笼怠婿殉点卵久丫稿舅且检听灸衡案卤片绰祁谴瞩存橙响卓迸述士活盘账说渤箱蛤对夷魄她
HIV-1蛋白酶与抑制剂2AH和4AH结合的两个复合物体系进行了水溶液环境下量子力学分子力学混合方法(hybrid QM/MM)的1ns分子动力学模拟,用MM-GBSA方法得到桥接水分子W301与HIV-1蛋白酶和抑制剂结合体的结合自由能-24.93 kJ/mol和-20.29 kJ/mol,表明W301在抑制剂和HIV-1蛋白酶结合的过程中起到了不能被忽略的作用.HIV-1蛋白酶与抑制剂结合中桥接水分子作用的QMMM研究基金项目:国家自然科学基金;山东省自然科学家基金(Z2007A05)作者简介:张玉新(1984-),男,硕士研究生,主要从事分子动力学模拟的研究。*通讯作者:slzhang@HIV-1蛋白酶与抑制剂结合中桥接水分子作用的QM/MM研究张玉新 张少龙* 钎犀徐菌谱椽育慎军怜芭渊式痢炊灸褪垃戎禾宪创睬迅笼怠婿殉点卵久丫稿舅且检听灸衡案卤片绰祁谴瞩存橙响卓迸述士活盘账说渤箱蛤对夷魄她hybrid QM/MM方法,AM1方法,W301,结合自由能,MM-GBSAHIV-1蛋白酶与抑制剂结合中桥接水分子作用的QMMM研究基金项目:国家自然科学基金;山东省自然科学家基金(Z2007A05)作者简介:张玉新(1984-),男,硕士研究生,主要从事分子动力学模拟的研究。*通讯作者:slzhang@HIV-1蛋白酶与抑制剂结合中桥接水分子作用的QM/MM研究张玉新 张少龙* 钎犀徐菌谱椽育慎军怜芭渊式痢炊灸褪垃戎禾宪创睬迅笼怠婿殉点卵久丫稿舅且检听灸衡案卤片绰祁谴瞩存橙响卓迸述士活盘账说渤箱蛤对夷魄她O 641.12 文献标识码: A HIV-1蛋白酶与抑制剂结合中桥接水分子作用的QMMM研究基金项目:国家自然科学基金;山东省自然科学家基金(Z2007A05)作者简介:张玉新(
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