生命奥秘2008.04月刊第二期.pdfVIP

生命奥秘 专题译述 本期导读―― 2007年年度技术方法概述 0 0 7 年年末，学者们纷纷评选出年度事件，年度人物，年度图 2片……，但唯独缺了年度技术方法。 技术方法是科学进步的驱动力，人们认为它们也应该受到重视。 经评选，2 0 0 7 年最备受瞩目的技术方法就是—— 新一代测序技术 （nex t - generation sequencing ）。虽然它并不是科学家在2007年发明的新技术，但这种测 序技术在2007年研究领域中起着十分重要的作用，此外，它还对相关研究领域产生 了异常深远的影响。 下文对2007年年度技术方法作出了详细的描述。 01 I 2007年：见证新一代基因测序技术的迅猛发展 007年，新一代测序技术因其在众多领域中的成功应用而得到广泛承认。 2 在北卡罗来纳州立大学 （North Carolina State University ）毒理学大楼里，小型基 因组实验室主任Nigel Deighton和其他研究人员一道，依靠来自罗氏诊断公司 （Roche Diagnostics ）的仅能 维持三个月研究的贷款，开发研制出实验室第一台新一代测序仪——454 GS FLX （见文后注释1）。他们花 了几天时间，处理一个同事保存的细菌DNA ，使其成为雾化状态，接着进行PCR扩增。随后他们将与磁珠连 接的PCR产物点样在平板上 （平板上有肉眼看不见的小孔），再将平板放入仪器，关上吊桥一样的舱门，仪 器便开始自动运行，进行序列测定了，而不再需要人工操作，于是他们便决定一起出去喝上一杯。 第二天，Deighton浏览了该仪器生成的关于被测细菌基因组的最新测序图。在首次试运行中，GS FLX 仪对待测序基因组测序的覆盖率达到原有仪器的6倍以上，平均阅读长度 （read length ）大约为250个碱基， “这个成绩对于第一次运行来说，算是不错的了。” Deighton说道。 在过去几年里，新一代测序技术平台在那些大型 测序实验室中得到快速发展，各种新技术犹如雨后春笋 般涌现。而在2 007 年，即使是在更小规模的实验室，例 如De ig ht o n 的实验室，也得以更好的运用这种测序平 台，George Church如是说，他在哈佛医学院 （Harvard Medical School ）研制出了相关的测序技术。 2005年推出的4 54 Life Sciences仪器，是进入市场 的首个测序平台。该公司于2007年被罗氏诊断公司收购。 而So lex a , Inc .在2006年6 月也推出了自己的新一代测序 仪器，该仪器将 “合成测序”化学法 （seq ue nc ing- by- synthesis chemistry ）与 “DNA簇技术” （DNA cluster 454生命科学公司所研发的新一代 technology ）相结合，随后该公司被Illumina收购。2007年 测序平台以光纤微流体技术和包 10月，A pplied Biosystems宣布其研制出了A BI SOLiD系 裹了待测DNA 片段的乳化液滴技 统，成为投入市场的唯一采用 “基于序列连接的化学法” 术为基础 （ligat ion-based ）的测序平台。在去年的全球基因组测 序会议上，Churc h就曾指出上述测序平台在多方面得以