铲鲟微卫星引物对中华鲟适用性研究.pdfVIP

第 26 卷 　第 6 期 水 生 生 物 学 报 Vol . 26 ,No . 6 2 0 0 2 年 1 1 月 ACTA HYDROBIOLOGICA SINICA Nov . , 2 0 0　2 铲鲟微卫星引物对中华鲟的适用性研究 邵昭君　赵　娜　朱　滨　周发林　常剑波 ( 中国科学院水生生物研究所,武汉　430072) ( ) ( 摘要 :将 21 对铲鲟 Scaphirhynchus platorynchus Rafinesque 的微卫星引物在中华鲟 Acipenser ) ( ) sinensis Gray 基因组 DNA 上进行 PCR 扩增 ,14 对 约占 67 % 引物得到了扩增产物 ,其中有 10 ( ) ( ) 对 约占 48 % 表现为多态性 ,但只有 2 对 95 % 引物 Spl100 和 Spl168 的多态性较高 ,且带 型清晰 ,可直接作为分子标记应用于相关的研究。此外 ,对具有特异性扩增 ,但有 Stutter band 现象的 4 对引物的部分可分离 PCR 产物进行了回收和测序 ,并对其中的 3 对引物的序列进行 了重新设计 ,最后得到两对可应用于中华鲟的引物 As100 和 Spl170b 。研究结果表明 ,对相 近种的微卫星引物进行优化设计来获得一个物种的微卫星引物是一条简捷有效的途径。 关键词 : 中华鲟;铲鲟 ;微卫星引物 ; 引物重新设计 ( ) 中图分类号:5965215 　　文献标识码 :A 　　文章编号 2002 在鲟鱼类微卫星的研究中 ,May 等在湖鲟的基因组文库中筛选出 11 个微卫星位点 , 并在 6 种鲟属鱼类和 2 种铲鲟属鱼类上进行了测试[1 ] 。随后 ,McQuown 等又在铲鲟的 3 个亚基因组富集文库中选取 172 个克隆进行测序 ,对其中的 113 个序列进行了引物设计 , ( 最终得到 108 对特异性的微卫星引物 , 并分别在苍铲鲟 Scaphirhynchus albus Forbes ) ( ) ( ) Richardson ,高首鲟 Acipenser transmontanus Richardson ,湖鲟 A fulvescens Rafinesque 和中 ( ) [2 ] [12 ] 吻鲟 A medirostris Ayres 上进行了测试 。朱滨等从 11 对湖鲟的微卫星引物 中筛选 出4 对引物在中华鲟上进行了测试 ,并评价了它们应用于中华鲟亲子关系分析研究的可 行性[3 ] 。另外 ,Zhu 等利用从湖鲟的 3 个多态性较高的微卫星位点以及铲鲟的 Spl168 位 点作为分子标记 ,对中华鲟人工放流个体占长江口幼鲟群体的比例进行了估算[4 ] 。作者 从铲鲟的 108 对微卫星引物中[2 ] ,选择 21 对引物对中华鲟基因