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系统生物学及中医药学探究摘要：用系统的思想和方法对多因素复杂性疾病进行研究的关键是要采取中医的整体性策略，完整地把握人体水平的病理生理变化特性，并进行“自上而下式”的还原分析，直至在分子水平上阐明疾病的发生和发展机制。“系统生物学”的研究方法更符合多基因复杂性痰病的特点，能够充分发扬祖国医学的优势，有力推动中医学和西方现代医学研究的汇聚和融合。 关键词：系统生物学；中医药；整体论；还原论 中图分类号：R2-03　文献标识码：A　文章编号：1673-7717(2009)05-0955-03 随着生命科学的发展，21世纪人类对重大疾病的控制和预防将会出现新的模式，将会逐渐产生讲究科学、注重人文、强调3P医学(即预防、预测和个性化医疗)的“新医学”。目前西方医学界有两个发展趋势值得我们关注，一是在系统生物学的驱动下医学研究开始引入“系统”和“整合”的思维方法；另一个趋势是现代医学开始重新认识东方的传统医学，尤其是中医学，试图在中医的理论体系中寻找更为行之有效的治疗思想。不久前在北京召开的《系统生物学与中医药的发展》第291次香山会议标志着“系统生物学技术”将逐步在中医药现代化研究中占据举足轻重的地位。笔者想谈谈中医药与系统生物学的关系，并着重介绍和探讨一种以系统生物学技术为研究工具、以中医理论为指导的新的中医学研究思想。 1　西方医学发展的成功和困惑 韦伯斯特词典对“医学”的解释是“维持健康，预防、缓解、治愈疾病的一门科学和艺术(The science and 8n dealingwith the maintenance of health and the prevention，alleviation，or cure of disease)”。由于人是疾病的主体和研究对象，医学的研究势必有别于其他学科，在疾病及其防治方法的认知和探索过程中，既需要追求其客观性和物质性的结果(科学性)，又需要顾及意识和精神的作用(人文化)。医学同步于人类文明的发展，在人类有意识的积累和传播与疾病作斗争的生存知识中孕育形成，在人类思维和文化活动的逐渐成熟下逐步系统化。我们今天的东西方两大医学体系就是在各自的哲学思想和文化母体的孕育中发展，形成了迥然不同的学术思想和思维方式。以还原论为基础的现代西方医学的发展，逐步淡化和摒弃人文的因素，更倾向于用数学、物理、化学那样的自然科学来定位和评价自身的研究。其理论特点是将人视作为一部可分割和还原的精致的机器，当一个部分发生故障(即产生一种疾病)时，医生需要寻找并修复这个损坏的部位以达到治愈疾病的目的。现代医学为人类的健康事业作出了巨大的贡献，人们对生命体的物质构成及其功能的认识达到了前所未有的深度、广度和清晰度。但与此同时，在物质文明高度发展的今天人类在大幅度减少某些急性病的致死率后，越来越多地面临着包括心脑血管疾病、癌症、糖尿病、免疫性疾病等慢性高致死性或“终身性”疾病的困扰，也就是说我们采用从人体器官到细胞再到基因的科学性的还原方法对一大批慢性复杂性疾病的研究收效甚微，这不能不说明现代西方医学这种研究模式自身存在着某些缺陷。适于我们人类生存的世界是复杂的，但这个宏大的生态系统(Eco-system)之维系来自于世上万物之间的相互联系和相互依存性(Inter-dependence)。人体被认为是迄今人类研究对象中最为复杂的一个生物系统，其复杂程度主要体现于各组成部分和各功能网络之间相互联系和相互作用上。而近现代医学在还原和简化的理论指导下分工越来越细，“间隔”越来越多，致使整个医疗系统和疾病治疗的实施过程渐趋“破碎诊治化(Fragmentization)”。譬如在一些医疗机构，呼吸科的医生就不必甚至不会看贫血、出血、血栓形成相关疾病，研究血小板的就不一定关注凝血因子等相关因素了。但是与疾病相关的体内物质基础很可能只是疾病发生的部分原因，几乎所有的复杂性疾病都是受到多基因和环境的影响。事实上可以通过人类疾病谱的变化，了解遗传因素和环境因素在疾病发生、发展过程中的作用。在我国东部发达地区与西部欠发达农村地区的社会二元结构以及环境因素在疾病谱上也能反映出来。在城市，癌症、心血管疾病和脑血管疾病在死亡原因中分列前3位，此后是呼吸性疾病，如阻塞性肺部疾病等，在各种癌症中，由于饮食结构的变化城市人结肠癌发病率在近年迅速上升，目前已位居前三；而在农村，呼吸性疾病则排在首位，不过近年来癌症和心脑血管的发病率都在快速上升。呼吸性疾病通常被认为是发展中国家的标志性疾病，这说明中国同时具有发达国家和发展中国家的疾病谱，其中居民生存环境的变化在疾病谱的改变中扮演着越来越重要的角色。因此，现代医学那种注重对单个基因、单个靶点的对抗性疗法(Allopathy)难以解决复杂的疾病问题。专家们认为，以往历经10余年