重构符合自然历史的演化树是系统生物学的终极目标-昆虫学报.PDF

昆虫 学 报 重构符合自然历史的演化树是系统生物学 的终极目标 任 东 首都师范大学生命科学学院 北京 摘要 从自然历史的角度对单系群特征 系统发育和自然分类系统的概念做出了澄清和解释 自然分类是仅包含单系群全体成员和它们之间亲缘发育关系和自然演化过程的分类 只有包括所 有成员在内的单系群才能称为一个自然分类系统 目前生物系统学主要使用分支分析方法重建自 然历史演化过程 在编写算法语言和程序时作者常将注意力集中在形态和分子数据的获得运算 过程和算法的改进而忽略了支序分类学的简约原则等假设前提和它的理论缺陷 由此在系统发 育重建的过程中存在 个常见的误区 在一个单系类群中包括的成员不完全却声称是一个自 然系统 将通过数学和程序运算出来的 简约或最似然 的亲缘发育关系当作自然系统 自 然单系类群往往具有漫长的演化历史人类无法直接观察和在实验室中重复 利用支序分类原理 构建的单系类群的发育关系只是一个单系类群之间的最 简约或最似然 的亲缘发育关系并不 能真正反映自然历史的本来面目 古生物学虽然有较好的时空框架但可提供的特征数量和精度 不够 现生生物的各种特征和遗传数据虽然相对充分但对于具有较长演化历史的类群由于缺失 了大量关键成员推导出的系统发育关系可能都是并系或复系无法构成一个自然系统 因此只用 现生生物宏观和基因组信息重构具有较长演化历史的生物类群的自然系统是无法实现的 只有利 用分子和形态的全证据从宏观和微观两个层面古代和现代相结合采用多种技术和研究手段对 一个单系类群的全体成员进行研究才能真正做到自然分类 在这个过程中可以利用 个原则对 分类系统是否符合自然历史发展进行检验 关键词 单系 并系 分支分析 自然历史 自然分类系统 中图分类号 文献标识码 文章编号 基金项目 国家自然科学基金项目 教育部创新团队发展计划 作者简介 任东 男 年生 河南沁阳人 教授 研究方向为昆虫起源与系统演化 收稿日期 接受日期 昆虫学报 卷