基于高通量测序的凡纳滨对虾的转录组分析deepsequencing-based.pdfVIP

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  • 2017-08-30 发布于天津
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基于高通量测序的凡纳滨对虾的转录组分析deepsequencing-based.pdf

基于高通量测序的凡纳滨对虾的转录组分析deepsequencing-based

水生生物研究 2013 年,第2 卷 Shuisheng Shengwu Yanjiu, 2013, Vol.2 研究报告 Research Report 基于高通量测序的凡纳滨对虾的转录组分析 曾地刚 陈秀荔 谢达祥 赵永贞 杨春玲 马宁 李咏梅 陈晓汉* 广西壮族自治区水产研究所, 广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室, 南宁, 530021 * 通讯作者, gxnnscs@126.com 摘 要 凡纳滨对虾是世界养殖最广泛的甲壳动物,但是目前凡纳滨对虾的基因组及转录组数据还比较缺 乏。为了获得凡纳滨对虾的转录组信息,本研究应用454 高通量测序技术对凡纳滨对虾肝胰腺的转录组进 行测序。获得了500 177 条凡纳滨对虾EST ,平均长度363 bp。拼接获得了20 225 条unigene ,长度范围50~ -5) ,结果 8 980 bp,平均长度507 bp。所有unigene 与NCBI 的非冗余蛋白质数据库(Nr)进行相似搜索(E 值 10

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