稻曲病菌 V-2 菌株细菌人工染色体文库构建及分析.PDFVIP

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稻曲病菌 V-2 菌株细菌人工染色体文库构建及分析

微生物学通报 Sep. 20, 2013, 40(9): 1715−1722 Microbiology China © 2013 by Institute of Microbiology, CAS tongbao@ 生物实验室 稻曲病菌UV-2 菌株细菌人工染色体文库构建及分析 1 1 1 2 3 1* 刘庆丽 王晓明 王革娇 罗朝喜 谭新球 罗美中 (1. 华中农业大学 生命科学技术学院 湖北 武汉 430070) (2. 华中农业大学 植物科学技术学院 湖北 武汉 430070) (3. 湖南省农业科学院植物保护研究所 湖南 长沙 410125) 摘 要: 【目的】稻曲病(Rice false smut)是由稻曲病菌[Villosiclava virens (Cooke) Tak.] 引 起的严重危害水稻的真菌病害。构建稻曲病菌 UV-2 的大片段 DNA 细菌人工染色体 (Bacterial artificial chromosome, BAC)文库, 为致病相关基因的鉴定及在图位克隆、比较基 因组学等方面的研究奠定基础。【方法】以幼嫩菌丝为材料制备大分子基因组DNA 包埋 块, 用Hind III 部分酶解后经脉冲凝胶电泳筛选, 回收大片段DNA 并与pIndigoBAC536-S 载体连接, 连接产物转化大肠杆菌菌株 DH10B T1 Phage-Resistant 细胞后进行蓝白斑筛 选, 白色菌落捡入384 孔板置于−80 °C 低温保存。【结果】成功构建UV-2 菌株的高质量、 高覆盖度的BAC 文库, 该文库共含 10 368 个克隆, 平均插入片段为 124.4 kb, 空载率小 于1%, 约覆盖该菌基因组的36.8 倍。【结论】克服了真菌大分子基因组DNA 制备难控制 的技术难题, 建立了首个稻曲病菌的BAC 文库。该文库已作为一种公共基因组资源向研 究者开放(http://GR)。 关键词: 大分子DNA, 细菌人工染色体, 水稻, 稻曲病, 稻曲病菌 基金项目:农业部公益性行业专项项目 (No. 200903039-3) *通讯作者:Tel: 86-27 : mzluo@ 收稿日期:2012-11-13; 接受日期:2013-01-06 1716 微生物学通报 Microbiol. China 2013, Vol.40, No.9 Construction of a bacterial artificial chromosome library of Villosiclava virens UV-2 genome LIU Qing-Li1 WANG Xiao-Ming 1 WANG Ge-Jiao 1 LUO Chao-Xi2 TAN Xin-Qiu3 LUO Mei-Zhong 1* (1. College of Life Science and Technology, Huazhong Agricultural University, Wuhan,

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