rapd用于20株嗜酸氧化亚铁硫杆菌菌株亲缘性-中国有色金属学报.pdf

第 24 卷第 2 期 中国有色金属学报  2014 年 2 月  Volume 24 Number 2  The Chinese Journal of Nonferrous Metals  February2014  文章编号：1004­0609(2014)02­0569­08  RAPD 用于 20 株嗜酸氧化亚铁硫杆菌菌株亲缘性研究 吴学玲，范宏伟，段 红，张真真，刘莉莉，刘新星  (中南大学 资源加工与生物工程学院，长沙  410083)  摘 要：为研究中国 20 株嗜酸氧化亚铁硫杆菌菌株的基因多样性，以及基因指纹技术分类与嗜酸氧化亚铁硫杆 菌生理生化特性的相关性，使用 20种随机引物，通过 PCR 扩增 20 株菌株的基因组 DNA，并分析凝胶电泳条带 的有无，使用 Jaccard 系数和 UPGMA分析菌株间相关性。20种引物产生的条带将 20株菌株分成了 5组，菌株间 相关性系数最小为 35.1%(YTW与 DXS)， 而相似系数最大为 96.9%(BY­0502 与 DXS，D Y26 与 DY30)。 结果表明：  20株来 自不同地区的嗜酸氧化亚铁硫杆菌株具有较高的多样性， 并且亲缘性分类与各菌株取样地以及最大铜离子 耐受能力分类，有较高的分类相似性，说明RAPD技术拥有在嗜酸氧化亚铁硫杆菌内分类鉴定菌株的能力。 关键词：嗜酸氧化亚铁硫杆菌；RAPD；多样性 中图分类号：Q751  文献标志码：A  RAPD to study relatedness of  20 Acidithiobacillus ferrooxidans strains  WU Xue­ling, FAN Hong­wei, DUAN Hong, ZHANG Zhen­zhen, LIU Li­li,LIU Xin­xing  (School of Minerals Processing and Bioengineering, Central South University, Changsha 410083, China)  Abstract: To study the genome diversity of 20 Acidithiobacillus ferrooxidans strains in China, and the relationship  between the genome classification and physiological­biochemical characteristic of Acidithiobacillus ferrooxidans, DNA  was amplified by PCR and twenty random primers, amplification products were separated by gel electrophoresis and  photographed under UV light. The RAPD (Randomly Amplified Polymorphic DNA) profiles were compared on the basis  of the presence or absence of each DNA band, and strain diversity was calculated using the Jaccard’s coefficient and  UPGMA  (Unweighted Pair­Group Arithmetic Average Clustering)  cluster  analysis.  The primers used in  this  stu