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作用于InhA的吡咯类抗结核病药物对接模型的构建

第29 卷 第4 期 计算机与应用化学 Vol.29, No.4 2012 年4 月28 日 Computers and Applied Chemistry April 28, 2012 作用于 InhA 的吡咯类抗结核病药物对接模型的构建 * 周珊珊,詹晓平,毛振民 (上海交通大学药学院,上海,200240 ) 摘要:目的:通过对接研究,初步建立作用于InhA 的吡咯类抗结核病药物的筛选模型。方法:采用Gold 3.01 分子对接软件, 评估已报道的吡咯类化合物衍生物的活性,并使用Fitness 打分函数评价分子对接结果。结果:初步建立了分子对接与药物活性 的药物筛选模型,建立的模型的r2 为0.829,对测试集化合物的活性预测结果与实验数据相关性很好,表明模型预测能力较强, 并分析出S 构型药物分子具有更好的活性。结论:Gold 对接所建立的模型的预测能力比较强,可以用于同类化合物的药物筛选, 为新的抗耐药结核分枝杆菌的药物筛选提供了思路。 关键词:吡咯;InhA ;分子对接;抗结核病 中图分类号:TQ015.9; TP391.9; O6-39 文献标识码:A 文章编号:1001-4160(2012)04-427-430 1 引言 物[12] ,具有相同的骨架结构(如图1 所示) ,活性之间具有 较好的可比性。所选的化合物共26 个,分子按照母环上 结核病是患者感染结核分枝杆菌后引发的慢性传染 的手性碳原子可分为R 构型和S 构型,作为分子对接的 病[1] ,正常人感染结核分枝杆菌后,并不直接发病,而当 初始构象。 抵抗力低下时开始发病。由于持续的环境污染和艾滋病 O X X 的传播、蔓延,结核病的发病率呈逐年上升趋势。我国 N R X X N H 现有肺结核病人约500 万,每年约有13 万人死于结核病。 H COOC Br O 3 Br 结核病患病和死亡人数在全国甲乙类法定报告传染病中 母环分子 compd.1 compd.2 compd.3 compd.4 [2]

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