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甲型H3N2亚型流感病毒血凝素及神经氨酸酶基因变异分析的研究进展
综述
甲型H3N2亚型流感病毒血凝素及神经氨酸酶
基因变异分析的研究进展
【摘要】 流感病毒最显著地特点是极易发生变异而引起新的流行。为了探讨甲型H3N2亚型流感病毒(A/H3N2)血凝素(HA)及神经氨酸酶(NA)基因动态变化情况,本文对近几年各地区对H3N2的HA及NA基因变异分析进行了归纳总结。
【关键词】 流感病毒,H3N2亚型;HA;NA;基因变异
甲型H3N2亚型流感病毒(influenza A/H3N2 viruses,A/H3N2)自1968年引起世界大流行以来一直是人群中主要的流感亚型之一,其抗原漂移的动力学、分子特性和基因变异与流感发生和流行的关系是近几年研究的热点[1]。A/H3N2全基因组共有8个片段,编码10种以上不同的蛋白,其中血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)位于流感病毒球形结构的表面,在病毒的感染、增值及变异中起着重要的作用[2]。为明确H3N2亚型流行株基因变异趋势,本文从其HA及NA两个基因序列方面,分别阐述了基因特性分析的研究进展。
1.HA基因进化
A/H3N2的HA基因变异是最快的。在病毒的受体识别和复制中起重要作用,包括识别和结合宿主细胞表面的受体,使毒粒囊膜和和宿主细胞膜发生融合并导致溶解,使病毒基因组进入细胞质并开始复制等。这些活动与抗原决定簇和受体结合位点(RBS)所在的HA重链区(HA1区)关系最密切。
1.1 HA1基因变异与分析
从中国H3N2HA1基因进化树可以看到典型的梯形树形,HA1进化树是一个以主干向上发展,以很短的侧枝为特征。对2007~2010年无锡地区分离的42株H3N2流感病毒的HA基因进行分析,也表明核苷酸序列的进化树呈斜长型,进化的路径表现为一主要的进化主干向上发展[3]。树的主干很长,基本是按毒株出现的时间先后发展。进化树侧枝很短提示了新旧毒株的交替速度很快。而中国1995~2005年H3N2亚型人流感病毒HA1基因序列分析也表明我国1995~2005年流行的H3N2毒株HA1的序列位点不断发生变化。从进化树的氨基酸变异距离可以看到这期间有几次毒株HA序列与前一个树枝有明显的变化发生[4]。
1.2 HA1基因推导的氨基酸位点变化
由HA1基因变异推导出,氨基酸位点的变化多位于抗原决定簇,但一些非抗原位点也能发生改变并能持续存在。其中抗原A区和B区参与变化更加频繁(X线晶体结构研究表明,H3N2 亚型流感病毒HA1蛋白上的抗原决定簇分为5个区)。深圳市2005~2007年H3N2亚型的HA1区氨基酸变异分析也得出了相同的结论[1]。变化位点分布于多个抗原区域时往往发生较大的流行。非抗原位点的改变能够在以后多数毒株中持续存在, 显示了其在维持新毒株一些特性中的重要性, 但其对新流行出现的作用还不清楚。中国不同年份毒株HA1基因每年都有新的位点改变, 但每年变化的幅度不同。
2.NA基因进化
神经氨酸酶(NA) ,又称唾液酸酶,是流感病毒主要的表面糖蛋白之一。NA以四聚体形式存在,可以水解唾液酸,帮助成熟流感病毒脱离宿主细胞并感染新的细胞,在流感病毒生活周期中具有重要的作用。同时,NA具有很强的免疫原性,可以有效诱导机体产生特异性抗体,是制备流感病毒疫苗重要的抗原和流感治疗药物作用靶点之一,也是甲型流感病毒亚型鉴定的重要依据。然而,NA具有高度的变异性,能够导致流感病毒在疫情的周期性流行中产生抗原漂移,为流感病毒的预防、控制和治疗带来诸多困难[5]。
2.1 NA基因变异与分析
NA区基因变异较HA1区保守[6]。我国历年来NA基因的进化路径主要是以一主要的进化主干伴随着多侧支的方式进化,序列的差距与年代大体成正比,年代相隔越长,序列差异越大。NA的进化不存在明显的地域特征,流感病毒株新变种的出现,在时间上无周期性[7]。而疫苗株在我国历年来NA的基因进化树上存在明显的滞后现象。NA基因各年间的进化率呈折叠形,流行高峰年份的毒株进化率位于峰点。
2.2 NA基因的氨基酸位点变化
从整体上看,氨基酸的进化速度大于核苷酸,抗原决定簇位点的进化最快,茎部与跨膜区次之,但是流行高峰期,具体到哪些位点会发生变异,没有规律可言。从中国1996~2005年间H3N2亚型人流感病毒NA基因分析中得知, NA历年来只有48%的氨基酸位点出现变异,大部分位点保守且没有氨基酸的缺失与插入。NA的酶活性位点高度保守,且我国1996~2005年间在基因水平上没有监测到耐药株。二硫键和糖基化位点相对保守,糖基化位点突然出现与消失可能是引起流感流行的原因之一。通过分析还发现143、267和385位氨基酸的变异率高于抗原决定簇位点,但具体生物学意义不清楚。
参考文献
张顺祥,谷利妞等.深圳市2005-2007年H3N2亚型流行性感冒病毒流行病学和分子变异特征.中
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