生物信息学变态反应学中的应用.PDFVIP

· · JournalofTropicalMedicineVol.6No.4Apr.2006 470 文章编号 ( ) [ ]1672-3619200604-0470-03 综述 · · 生物信息学在变态反应学中的应用 杜智华 刘志刚 , 深圳大学生命科学学院 深圳 ( , 518060) 摘要 变态反应疾病是临床上的常见病 多发病 是当前世界性的重大卫生学问题之一 随着现代医学 【 】 、 , 。 、 免疫学和分子生物学的迅速发展 变应原以及相关数据的快速增加 生物信息学在变态反应学中的重要性越来 , , 越突出 生物信息学以计算机为工具对变应原数据进行储存 检索和分析 是对传统生命科学在变态反应学研 。 、 , 究中的一个重要补充 本文主要介绍了生物信息学在变态反应研究中的重要应用 包括变应原的结构分析 蛋 。 , , 白质致敏性的评估 变应原之间交叉反应的预测 确定 细胞和 细胞表位的分析 通过这些方法的介绍 旨在 , , B- T- 。 , 说明生物信息学在变态反应研究中的应用价值。 关键词 变态反应 变应原 致敏性评估 生物信息学 【 】 ; ; ; 中图分类号: 文献标识码: R392.8 A 过敏反应又称超敏反应或变态反应 是指机体受同一 例如用于序列分类 相似性搜索 序列编码区识别、 , 、 、DNA 变应原再次刺激后产生的一种异常或病理性免疫反应 变 分子结构与功能预测 进化过程的构建等方面的计算工 。 、 应原进入患者体内 随即被巨噬细胞 抗原呈递细胞 具已成为变态反应研究工作的重要组成部分 针对核酸 , ( 、 。 APC 细胞 捕获 巨噬细胞对变应原消化 处理后将抗原表位 序列的分析就是在核酸序列中寻找变应原基因 找出基 ) , 、 , 决定簇传递给辅助性 淋巴细胞 再传给 细胞。 细胞 因的位置和功能位点的位置 以及标记已知的序列模式 T , B B , 分裂并产生免疫球蛋白 ( ), 与人体自身的肥大细 等过程 针对蛋白质序列的分析 可以预测出蛋白质