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酶切位点保护碱基表格(Restriction sites protect base tables)
酶切位点保护碱基表格(Restriction sites protect base tables)
Protection of restriction sites during PCR design primers
enzyme
oligonucleotide sequence
Cutting rate%
2 hr
20 hr
Acc I
GGTCGACC
CGGTCGACCG
CCGGTCGACCGG
Zero
Zero
Zero
Zero
Zero
Zero
Afl III
CACATGTG
CCACATGTGG
CCCACATGTGGG
Zero
90
90
Zero
90
90
Asc I
GGCGCGCC
AGGCGCGCCT
TTGGCGCGCCAA
90
90
90
90
90
90
Ava I
CCCCGGGG
CCCCCGGGGG
TCCCCCGGGGGA
Fifty
90
90
90
90
90
BamH I
CGGATCCG
CGGGATCCCG
CGCGGATCCGCG
Ten
90
90
Twenty-five
90
90
Bgl II
CAGATCTG
GAAGATCTTC
GGAAGATCTTCC
Zero
Seventy-five
Twenty-five
Zero
90
90
BssH II
GGCGCGCC
AGGCGCGCCT
TTGGCGCGCCAA
Zero
Zero
Fifty
Zero
Zero
90
BstE II
GGGT (A/T) ACCC
Zero
Ten
BstX I
AACTGCAGAACCAATGCATTGG
AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA
CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT
Zero
Twenty-five
Twenty-five
Zero
Fifty
90
Cla I
CATCGATG
GATCGATC
CCATCGATGG
CCCATCGATGGG
Zero
Zero
90
Fifty
Zero
Zero
90
Fifty
EcoR I
GGAATTCC
CGGAATTCCG
CCGGAATTCCGG
90
90
90
90
90
90
Hae III
GGGGCCCC
AGCGGCCGCT
TTGCGGCCGCAA
90
90
90
90
90
90
Hind III
CAAGCTTG
CCAAGCTTGG
CCCAAGCTTGGG
Zero
Zero
Ten
Zero
Zero
Seventy-five
Kpn I
GGGTACCC
GGGGTACCCC
CGGGGTACCCCG
Zero
90
90
Zero
90
90
Mlu I
GACGCGTC
CGACGCGTCG
Zero
Twenty-five
Zero
Fifty
Nco I
CCCATGGG
CATGCCATGGCATG
Zero
Fifty
Zero
Seventy-five
Nde I
CCATATGG
CCCATATGGG
CGCCATATGGCG
GGGTTTCATATGAAACCC
GGAATTCCATATGGAATTCC
GGGAATTCCATATGGAATTCCC
Zero
Zero
Zero
Zero
Seventy-five
Seventy-five
Zero
Zero
Zero
Zero
90
90
Nhe I
GGCTAGCC
CGGCTAGCCG
CTAGCTAGCTAG
Zero
Ten
Ten
Zero
Twenty-five
Fifty
Not I
TTGCGGCCGCAA
ATTTGCGGCCGCTTTA
AAATATGCGGCCGCTATAAA
ATAAGAATGCGGCCGCTAAACTAT
AAGGAAAAAAGCGGCCGCAAAAGGAAAA
Zero
Ten
Ten
Twenty-five
Twenty-five
Zero
Ten
Ten
Ninety
90
Nsi I
TGCATGCATGCA
CCAATGCATTGGTTCTGCAGTT
Ten
90
90
90
Pac I
TTAATTAA
GTTAATTAAC
CCTTAATTAAGG
Zero
Zero
Zero
Zero
Twenty-five
90
Pme I
GTTTAAAC
GGTTTAAACC
GGGTTTAAACCC
AGCTTTGTTTAAACGGCGCGCCGG
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Zero
Zero
Seventy-five
Zero
Twenty-five
Fifty
90
Pst I
GCTGCAGC
TGCACTGCAGTGCA
AACTGCAGAACCAATGCATTGG
AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA
CTGCAGAA
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