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我国五大湖三角帆蚌群体its-1序列变异分析-湖泊科学
J. Lake Sci.(湖泊科学), 2008, 20(2): 208-214
. E-mail: jlakes@
©2008 by Journal of Lake Sciences
*
我国五大湖三角帆蚌群体 ITS-1 序列变异分析
∗
1 1,2** 1 1
王建军 , 李家乐 , 汪桂玲 , 白志毅
(1: 上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室, 上海 200090)
(2: 上海高校水产养殖学E-研究院, 上海 200090)
摘 要: 对我国五大淡水湖 : 鄱阳湖、洞庭湖、太湖、巢湖、洪泽湖, 鄱阳湖内包括进贤、余干、珠湖、都昌、湖口、永修, 合
计 10 个群体三角帆蚌 78 个个体核糖体 DNA 基因转录间隔子 ITS-1 进行 PCR 扩增、序列测定, 获得 78 条长度为 430 bp 的
同源序列. 同源基因序列分析显示, 五大淡水湖 10 个群体三角帆蚌 78 条 ITS-1 序列片段, G+C 的含量都明显高于 A+T 的含
量. 鄱阳湖三角帆蚌的核苷酸多态性指数最高, 而巢湖的核苷酸多样性指数最低. 基于 ITS-1 序列片段的遗传距离表明, 鄱阳
湖内六个点群体间遗传距离很小, 在 0.0071 到 0.0092 之间. 五大湖间三角帆蚌群体遗传距离较远, 在 0.0752 到 0.1381 之间.
ITS-1 序列片段构建系统树显示, 鄱阳湖 6 个群体聚在了一起为单独一支, 并与巢湖群体亲缘关系相近 . 洞庭湖群体和洪泽湖
群体亲缘关系相近, 单独为一支. 太湖群体从鄱阳湖、巢湖群体分离开来, 单独为一支.
关键词: 三角帆蚌; 转录间隔区; ITS-1; 遗传多样性; 亲缘关系
Sequence variation of Ribosomal DNA Internal Transcribed Spacer 1 of Hyriopsis
cumingii from the Five Freshwater Lakes of China
1 1,2 1 1
WANG Jianjun , LI Jiale , WANG Guiling BAI Zhiyi
(1: Key Laboratory of Aquatic Genetic Resources and Aquacultural Ecology Certificated by the Ministry of Agriculture, Shanghai
Fisheries University, Shanghai 200090, P.R.China)
(2: Aquaculture Division , E-Institute of Shanghai Universities, Shanghai 200090, P.R. China)
Abstract: The internal transcribed spacer 1 (ITS-1) was amplified from Hyriopsis cumingii in the five large lakes of China: Lake
Poyang, Lake Dongting, Lake Taihu, Lak
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