两种蛤仔线粒体16srrna基因和coⅰ基因的序列比较-海洋科学.pdfVIP

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2017-09-04 发布于天津
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两种蛤仔线粒体16srrna基因和coⅰ基因的序列比较-海洋科学.pdf

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两种蛤仔线粒体16srrna基因和coⅰ基因的序列比较-海洋科学

16S rRNA CO 1 2 3 2 , , , (1. , 264006; 2. , 266003; 3. , 266071) 摘要: 对菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)和杂色蛤仔(Ruditapes variegata) 的线粒体 16S rRNA 基因和 CO Ⅰ基因序列进行了分析。结果表明, 16S 序列共有 117 个变异位点, CO Ⅰ序列共有160 个变异位点, CO Ⅰ基因编码的219 个氨基酸序列中有 29 个不同。根据 16S 序列和 CO Ⅰ基因编码的氨基酸序列进行聚类分析, 两种蛤仔与硬壳蛤(Mercenaria mercenaria)之间的聚类结果并不一致, 有必要对缀锦蛤亚科更多的相近种进行序列分析。关键词: 菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum); 杂色蛤仔(Ruditapes variegata); mtDNA; 16S rRNA 基因; CO Ⅰ基因中图分类号: S968.3 文献标识码: A 文章编号: 1000-3096(2011)10-0027-07 DNA(mtDNA) (Ruditapes) , , Fischer-Piette , (R.philippinarum) , (R. variegata) PCR , , DNA PCR , 16S CO , , mtDNA , Genbank 2 , , 1 材料与方法 Canapa [1-3] 16S rRNA 8 14 , 1.1 样品收集和 DNA 提取 6 , (R.philippinarum , RP) ; 8 , (R. variegata , RV) , DNA Barucca [4] 23 16S 12S 1.2 PCR 扩增、克隆和测序 , [10] Matsumoto [5-6] CO PCR : 16S Palumbi , 16sar-L (5′-CGCCTGTTTATCAAAAA- 17 , CAT-3′) 16sbr-H (5′-CCGGTCTGAACTCAGATCA-