srrna基因序列分析及其在细菌鉴别.pdfVIP

中华微生物学和免疫学杂志2OO4年3月第24卷第3期 ChinJMic~biolImmunol，March2004，Vol24，No．3 ． 检测技 术 ． 23SrRNA基因序列分析及其在细菌鉴别 诊断中的应用 洪帮兴 江丽芳 胡玉山 方丹云 郭辉玉 【摘要 】 目的 研究细菌23SrRNA基因序列的差异，为细菌鉴别诊断和相关研究提供科学依 据。方法 设计合适的通用引物、寻找恰当的扩增条件扩增常见细菌的23SrRNA基因片段。通过序 列测定和运用生物信息学分析不同种属细菌23SrRNA基因的保守序列、变异规律及菌株间种系进化 关系。结果 扩增出常见引起食源性感染的16属(种)细菌23SrRNA基因片段。部分扩增产物进行 了限制性酶切鉴定和序列测定。序列比较研究获得21个23SrRNA的通用保守序列，23SrRNA基因 保守序列与变异区在种系间呈间隔分布，大量变异区呈 “马赛克”式分布。种系间进化关系与 16S rRNA分析结果一致。结论 23SrRNA基因序列的分布规律为进行细菌的鉴别诊断及基因芯片的研 制提供了重要的理论和实验基础。 【关键词 】23SrRNA；同源性；遗传学 S既IIn∞