历山中国大鲵线粒体片段序列的测定及其遗传差异研究.PDFVIP

第27卷第6期 大 连 海 洋 大 学 学 报 Vol.27 No.6 2012年12月 JOURNAL OF DALIAN OCEAN UNIVERSITY Dec. 2012 文章编号:2095-1388(2012)06-0513-05 历山中国大鲵线粒体片段序列的测定 及其遗传差异研究 1、3 1 2 1 黄立群 ,仪慧兰 ,崔松林 ,郭军 摇 摇 摇 (1. 山西大学 生命科学学院, 山西 太原030006;2. 山西省水产科学研究所, 山西 太原030006; 3. 中国辐射防护研究院, 山西 太原030006) 摘要:对山西历山2尾野生大鲵Andriasdavidianus mtDNA 中Cytb和ATPase6基因的部分序列进行了检测, 并与GenBank 中收集的14尾外地样本进行比较, 用Mega 5郾0 软件对305 bp Cyt b片段和371 bp ATPase 6 片段进行分析。 结果表明: Cyt b片段有 10 个不同的单倍型, 共检测出14 个变异位点, 占核苷酸总数的 4郾58%, 其中有12个简约信息位点; ATPase6片段有13个不同的单倍型, 检测出30个变异位点, 占核苷 酸总数的8郾09%, 其中有18个简约信息位点, Cyt b 比ATPase6更为保守, 但两序列中碱基组成均表现为 鸟嘌呤缺乏 (18郾9%), 且多数变异发生在密码子第3位。 合并序列构建的分子系统树表明, 历山大鲵与 陕西、 四川及部分湖南个体聚为一支, 历山大鲵与广西样本的遗传距离最远, 与四川、 陕西样本的遗传距 离较近。 关键词:中国大鲵; 历山地区; Cyt b; ATPase6; mtDNA 中图分类号: Q346摇 摇 摇 摇 文献标志码: A 摇 摇 中国大鲵Andrias davidianus 俗称 “娃娃鱼冶, 中国大鲵不同种群之间的遗传关系, 对大鲵的人工 属于两栖纲、 有尾目、 隐鳃鲵科, 是现存个体最大 繁育和种质资源保护具有重要意义。 的两栖动物。 隐鳃鲵科有隐鳃鲵属 Cryptobranchus 线粒体 DNA (mtDNA) 由于呈母系遗传, 且 和大鲵属Andrias 2 个属, 共计3 个种, 其中隐鳃 碱基替换速率快, 无组织特异性, 是两栖类进化研 鲵属的北美隐鳃鲵 Cryptobranchus alleganiensis 分布 究中重要的分子标记, 被广泛应用于种群遗传多样 [5-6] 于美国东部, 大鲵属的日本大鲵Andriasjaponicus 性、 种群遗传结构及进化史等方面的研究中 。 [1] 和中国大鲵分别分布于日本和中国 。 中国大鲵 Cyt b 由于进化速度适中, 被认为是解决系统发育 [7-9] 是中国特有的珍稀有尾两栖动物, 属于国家二级保 问题最可信的分子标记之一 , 但单个线粒体基 护动物, 从水系看主要分布于长江中上游、 珠江上 因在反映脊椎动物系统发生关系时可能效果不 [2] [3] [10] 游及黄