primer60引物设计教程.docVIP

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  • 2017-09-05 发布于重庆
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primer60引物设计教程

primer 6.0 引物设计教程 首先,需要知道基因序列,如,我们要设计rat的 CK18 mRNA检测的引物,我们先到/ 这个网站查找CK18 mRNA的基因序列, 首先选择Nucleotide 然后在搜索栏输入基因序列号(如果不知道基因序列号则输入 rat CK18)如图 然后点击搜索,就会出现rat CK18 mRNA的基因序列 现在,往下拉就会看到基因序列 将这个序列复制到primer 6.0中就可以进行引物设计, 我们先打开peimer 6.0 破解版打开会出现这个对话框,关闭即可 将序列复制至这个对话框 点击 Add 出现下面对话框,这里可以选择引物在序列哪些地方设计引物,我一般不更改,也就是引物可以设计在整个序列,你也可查一下序列有几个区,一般引物应该跨两个区。 之后点击 primer Parameters 这里可以设置退火温度、引物长度、产物长度等,我一般只是更改产物长度,我一般设为100到300bp,因为如果产物太大,在染料法中会影响扩增效率, 之后点击 Search 之后出现下面对话框 点击OK 出现下面引物序列 这个时候引物设计完成,我们需要对引物进行验证,我一般到NCBI(/)上验证,进去后点击最下面菜单中的BLAST 之后点击Primer-BLAST 将前引物复制到图中位置 将后引物复制(注复制前引物用 Copy Sense Primer,复制后

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