徐海冬-鸡miRNA的研究进展.docVIP

《表观遗传学》课程作业 鸡表观遗传中miRNA的研究进展 学 院： 农学院 专 业：动物遗传育种与繁殖 学 号： 2111602010 研 究 生： 徐海冬 任课教师： 苏瑛 教授 分 数： 鸡表观遗传中miRNA的研究进展 徐海冬 （ 广东海洋大学农学院动物遗传育种实验室 广东·湛江 425088 ） 摘要：microRNA（miRNA）是参与基因转录后调控的之类重要的非编码小RNA分子。通过其调节，可以形成细胞水平和个体水平的基因表达的多样化。本文对鸡miRNA在染色体中的数量和分布进行了简要总结，鸡miRNA在免疫机能、胚胎发育和病毒感染方面的调控作用进行了归纳，并对鸡miRNA进一步研究作出了展望，以期为miRNA在禽类中的研究和生产实践中提供参考。关键词：鸡；microRNA；免疫；胚胎发育；病毒 microRNA（miRNA）是具有功能性的非编码单链小RNA（长约为19-24 nt），具有高度保守性。主要通过其5’端与靶基因mRNA的3’端的非翻译区特异性结合，对基因转录后的翻译进行调控，形成机体的细胞水平和个体水平的多样化。因为具有便于饲养，生长周期短，其卵便于体外观察和试验的优势，鸡已经逐渐成为研究脊椎动物的优秀模型。对于以鸡为模式生物研究miRNA的功能和调控机制对miRNA在禽类的开发和利用提供了重要的理论价值和经济效益。 1 鸡miRNA 的数量与染色体分布 目前，鸡miRBase数据库 (/) 中已公布684 条miRNA前体和791条miRNA 成熟体。其分布于不同的染色体中，其中6对大染色体（染色体1，2，3，4，5和Z）中miRNA的前体数目都在30以上，染色体1中最多（80条），这可能与染色体长度大、基因含量多、功能性复杂相关联。在染色体16、32和W中未发现miRNA。 与人的miRNA 前体 (1 600 条) 和miRNA成熟体 (2 042 条) 数目相比较而言，鸡miRNA的发现和挖掘可能还存在一定空间。Glazov等[1]利用深度测序法（Deep sequencing approach）对鸡胚的不同发育阶段 (5 d、7 d 和9 d) 测得了3个miRNA 库，得出950万条短序列他们对这些小RNA进行分类后发现，几乎检测到了所有先前已知的鸡miRNA 和它们各自的miRNA*序列（表达水平低的表示为miRNA*）。也发现了449条鸡miRNA（其中包含88条候miRNA），其中有430条为鸟类所特有的，6条miRNA是鸟类以外至少一个脊椎动物种属存在进化序列的保守性，13条miRNA是已知脊椎动物中miRNA在鸡中的保守序列。还发现存在39条额外的剪接来源的miRNA。我们相信随着研究的不断深入，鸡miRNA家族的新成员还会被逐渐发现并公布。 2 鸡miRNA 对免疫功能的调控 miRNA是基因表达的一类重要的转录后调控因子，但是关于每个miRNA的靶向调节的独立性功能还有待挖掘。有研究发现miRNA在免疫调控方面具有重要的作用。miRNA可与非特异性免疫体系构成“第一道防线”来抵御病原微生物的入侵。其病原微生物与宿主通过在miRNA水平的相互作用，合成和富集特定的miRNA，进而激活特定基因的表达。例如，AP-1和NF-κB等转录因子的激活会引起miR-155的增加[2]，而miR-155能够调节辅助性T细胞的分化和生发中心反应，进而产生最适T细胞依赖性抗体反应。miR-155也可以通过调节细胞因子量来调节T细胞的功能，miR-155也参与了B细胞的同型转化和特异性抗体产生及记忆细胞反应[3]。 动物体内的免疫系统需要处于免疫应答和免疫调节的平衡范围内，机体才能表现出良好的生长状态。与蛋白质亚基间的相互调节相比较，miRNA水平更能精细和定量的调节免疫系统。miRNA在T细胞发育和功能产生及B细胞发育和分泌抗体的免疫活动中存在时空表达的差异，这表明miRNA可以调控机体的特异性免疫反应。miRNA对免疫反应的相关基因存在较高的靶向特征，这说明miRNA在免疫反应中起重要的调控作用[4]。 目前，与免疫相关的miRNA报导已初步证明了其在鸡免疫系统中的重要作用。例如，Ahanda等[5]在鸡的免疫活性组织cDNA的研究中，不但发现了已知非编码的RNA（miRNA, snRNA, snoRNA），也发现了一些假定miRNA样的非编码RNA。表达谱分析鉴定后，发现在病毒感染前后，其发生了变化，并与组织内编码蛋白mRNA表达特征相一致。这表明此非编码RNA在免疫反应中具有重要作用。Trakooljul等[6]对鸡miR-143下游靶基因进行DNA微阵列和双荧光素酶报告检测，鸡胚淋巴细胞体