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人类基因组计划及其重要影响

人类基因组计划及其重要影响 ?由美、英、日、德、法、中六国参与的人类基因组计划(Human Genome Project, HGP),是人类文明史上最伟大的科学创举之一。其内容可简单地概括为遗传图、物理图与序列图的绘制,处于核心位置的是序列图的绘制——测定人类基因组的全部DNA序列,从而获得人类全面认识自我最重要的生物学信息。 ?? 1990年,原定15年完成,由于技术的成熟与基因组测序的规模化运作,以及来自商业竞争方面的压力,使HGP的完成日期不断提前,全部工作预计在2001年6月前完成。 今年6月26日,六国科学家共同宣布人类基因组工作框架图构建完毕,并将测序结果于次日向全世界公布,这标志着人类基因组计划进入了最后冲刺阶段。随着人类基因组“工作框架图”的构建完成,HGP对人类社会巨大的科学和经济意义正在逐渐显现,其影响广泛而深远。它带动和促进了生物产业和生命科学的发展,它着眼于基因组的整体理论、策略、技术,前所未有地加速了新基因发现及其功能研究的速度。自此,生命科学开始了以DNA序列为基础的,以生物信息学为导向的新纪元(sequence-based era)。同时,它也为未来生命科学研究的思想和方法论带来了革命性的改变。HGP对人类社会的影响将波及每一个人,将会对现有法律、道德、伦理甚至生活方式都带来冲击和思考。人类科学史上的任何事件都无法与之比肩。 ?? 造福全人类的计划 ?? HGP这一宏伟的旨在造福全人类的公益性计划,是人类第一次系统地解读和认识自我的科学创举。其核心内容是测定人的基因组脱氧核糖核酸(DNA)的全部序列,从而获得人类全面认识自我最重要的生物学信息,最终目标是提供由数万个基因“元素”组成的人体生物学“周期表”。人类遗传物质DNA的总和被称为人类基因组。它由大约30亿个碱基组成,其中含有约6万个作为生命活动基本单位的基因。人类基因组中蕴藏着生命的本质奥秘,它与环境相互作用,决定着人的生、老、病、死。这一生命本质同样适用于人类赖以生存的自然界中其他的生命体。 ?? 在自然科学史上,HGP的影响将远远超过“曼哈顿”工程和“阿波罗”登月计划,它是21世纪生命科学的基础和先导。它所倡导的“全球合作、免费共享”的人类基因组计划精神,已成为自然科学史上国际合作的楷模。世界各国也因此受益无穷。 ?? HGP有两个源头:一是美国能源部对原子弹爆炸幸存者及其后代的研究,科学家无法从一个或几个基因来解释,为什么随着繁衍代数的增加,核辐射造成的畸形等逐渐减少甚至消失;另一源头是美国的肿瘤研究计划也无法从一个或几个基因入手,揭示肿瘤的奥秘,更谈不上攻克癌症。1986年,诺贝尔奖得主杜尔贝科(R. Dulbecco)在《科学》(Science)周刊撰文回顾肿瘤研究的进展,指出要么依旧采用“零敲碎打”的策略,要么从整体上研究和分析人类基因组。 ?? 1990年,美国能源部(DOE)与国立卫生研究院(NIH)共同启动HGP,原定投入30亿美元,用15年时间完成该计划。英、日、法、德等国相继加入。 ?? 1998年5月11日,世界上最大的测序仪生产商美国PE Biosystems公司,以其刚研制成功的300台最新毛细管自动测序仪(ABI 3700)和3亿美元资金,成立了Celera Genomics公司,宣称要在3年内,以所谓的“人类全基因组霰弹法测序策略”完成人类基因组测序,并声称要专利200~400个重要基因,并将所有序列信息保密3个月。Celera公司已有雇员300多人,购买了号称“全球第三”的超大型计算机,号称拥有了超过全球所有序列组装解读力量总和的实力。就在六国共同宣布工作框架图构建完成的同一天,Celera公司宣称已组装出了完整的人类遗传密码。Celera公司此举,是对公益性的HGP的竞争与挑战。 ?? 1999年7月,中科院遗传研究所人类基因组中心暨北京华大基因研究中心,代表中国在人类基因组测序参与者索引(HGSI)注册,同年9月被正式接纳为“国际测序俱乐部”成员,测定3号染色体短臂上从端粒到标记D3S3610间大约30厘摩(centin,缩写为cM,是基因组遗传图上的图距单位,以减数分裂过程中两个位点间交换、重组的百分率表示,重组率1%即为1厘摩)的区域,从遗传图距离来看占整个基因组的1%。中国成为第六个参与人类基因组测序的国家。随后,国家南北方基因组中心加盟,共同完成这一任务。 ?? 简言之,HGP就是要绘制遗传图、物理图与序列图。遗传图又称连锁图,以遗传标记为“路标”。物理图以碱基数作为图距,以序列标记位标(STS)为标记。序列图是HGP的核心,它与遗传图、物理图密不可分,它本身又是核苷酸水平的物理图。 ?? 序列图的构建可大致分成两个阶段。第一阶段启动于1999年3月,在过去的14个月中,已完成了人类基因组绝大

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