computing inbreeding coefficients in large populations计算近交系数庞大的人口.pdfVIP

Original article Computing inbreeding coefficients in large populations THE Meuwissen Z Luo Institute of Animal Physiology and Genetics Research, Edinburgh Research Station, Roslin EH25 9PS, UK (Received 21 October 1991; accepted 15 April 1992) Summary - An algorithm for computing inbreeding coefficients in large populations is presented. It is especially useful in large populations because of the small size of the memory required, which is linear with population size, and its speed, if the number of generations involved is not too large, ie not larger than about 12. The method is compared with 2 other methods for computational speed and memory requirement. The presented algorithm is suited for situations where the inbreeding coefficients for a few new animals are to be computed given that their ancestor’s inbreeding coefficients were calculated previously. inbreeding coefficient / algorithm Résumé - Le calcul des coefficients de consanguinité dans de grandes populations. On présente un algorithme de calcul des coefficients de consanguinité pour de grandes populations. Il est particulièrement adapté à ces populations à cause du faible volume de mémoire d’ordinateur requis (il dépend linéairement de la taille de la population) et de la rapidité de calcul quand le nombre de générations impliquées n’est pas trop élevé (c’est- à-dire inférieur à environ 12). La méthode est comparée à2 autres méthodes du point de vue de la vitesse de calcul et de la mémoire requise. Le présent algorithme est également adapté aux situations de mise à jour où les coefficients de consanguinité correspondant à un faible nombre d’animaux nouveaux doit être calculé en tirant parti des coefficients calculés les anciens animaux. pour c