第九章 分子进化与系统发育.pptVIP

* * * * * * 输入n，选择neighbor-joining，使用邻接法做树 输入m，再输入1000，回车。Random seed，还是输入9。 然后输入y，回车。可见运算过程。算完后，文件夹中多了outtree和outfile两个文件。然后关闭neighbor程序。 consense?构建一致树 此时，exe文件夹中又多了一个outfile和一个outtree文件。现在一共有dnadistinfile，neighborinfile，outfile，outtree 等4个文件。 将outtree改名，如neighborintree 将outfile改名，如neighboroutfile 双击consense 不要改动参数，直接输入y，回车 然后可以看见多了两个文件，outtree和outfile outtree就是最终得到的一致树，使用treeview软件打开查看outtree文件。树文件另存为矢量图，使用Adobe illustrator编辑。 4. 使用MEGA建树的介绍 MEGA是图形化软件，操作界面比较人性化和简单。 举例如下： 01 AAATTTCCCGGGAAATTT 02 AAATTTCCGCCGAAATTT 03 AAAGGTGGCGCCAATTTA 04 AATGGTGGGCGCTTTAAA 网址和下载： 建立一个fasta格式的文件 ***.fa