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复旦研究生-2010-2的
BLASTBasic Local Alignment Search Tool;BLAST 流程;/BLAST;新版界面;BLAST系列程序选择流程;BLASTp;BLAST ID;BLAST 结果 (1 - 5);BLAST 结果 (1);BLAST 结果 (2);BLAST 结果 (3);BLAST 结果 (4);BLAST 结果 (5);分值和E值;分值是衡量查询序列同命中序列间相似性的测度。分值越高,命中序列与查询序列越相似。
E值是随机产生一个比所得分值高的对位排列的概率,即分值可靠性的测度。 E值越小, 所命中序列越可靠。
; E值计算公式:
E = K · m · n · e -λS
K, 一个与目标序列相关的经验常数
λ ,与计分(分值)系统相关的经验常数
m,查询序列大小
n,所查询数据库大小
S,分值;BLAST的新功能;Blast命中序列的系统树;Mega-Blast;/BLAST;PSI-BLAST;在全序列数据库中
搜索相似序列;两个序列间的查询;BLAST2;Evaluation only.
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Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;/BLAST基因组搜索;河豚基因组;河豚基因组;微生物基因组;微生物基因组;提供 BLAST的若干网站;本地 BLAST;E. coli K12 ;实例: 恐龙蛋DNA研究中的一场争论;恐龙蛋化石中的18s rDNA ;Evaluation only.
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Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;18sDNA 系统树;结 论; BLAST 的应用:
麻黄碱类化合物的进化起源假说;Dopamine能神经元结构与功能 ;Methamphetamine
(甲基苯丙胺)
;Ephedrine;麻黄碱在人体内的结合蛋白;Adrenergic Recptor Blast against Fungi;Dopamine Transporter Blast against Fungi;镰孢菌中的FG07634蛋白与DAT相似;若干解释;麻黄碱可能是防御物质的证据;FG07634蛋白的功能;Fusaric Acid—可能被FG07634转运的物质;Fusaric Acid能抑制Dopamine I 型受体活性 (中国抗生素杂志,2001)
Fusaric Acid能抑制植物Dopamine代谢途径中的Tyrosine Hydroxylase,人Dopamine代谢途径中的Dopamine b-Hydroxylase
Fusaric Acid是镰孢菌分泌的一种非特异性的毒素,在对植物侵染过程中与其他毒素有协同作用;同时在镰孢菌的不同生长时期也有不同的生理作用;相关问题探索
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