烟叶表面微生物类群两种检测方法的比较研究.PDFVIP

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烟叶表面微生物类群两种检测方法的比较研究

第 期 华东师范大学学报自然科学版 年 月 文章编号 烟叶表面微生物类群两种检测方法的 比较研究 龚 俊 刘玉配 李媛媛 华东师范大学 生态与环境科学学院 浙江天童国家森林生态系统野外观测研究站上海 上海烟草集团有限责任公司上海 摘要为研究克隆文库法和高通量测序两种方法对烟叶表面微生物类群的检测效果确定检测 烟叶表面微生物多样性的最优方法检测了基于细菌 和真菌 区域的烤烟表面微 生物类群的多样性 结果显示高通量测序得到的序列数量比克隆文库法多两种方法检测到 细菌的 数目相近但高通量检测的真菌 数目较多稀疏曲线显示高通量测序的数据 饱和度更高预计的群落多样性 指数和 指数克隆文库法均高于高通量测序法实 际的群落多样性 指数和 指数表明克隆文库法检测的细菌多样性略高而高 通量测序检测的真菌多样性略高在检测到的细菌和真菌种类上高通量测序略多于克隆文库 法两种方法检测的细菌优势类群基本一致为假单胞菌属不动杆菌属和鞘氨醇单胞菌属但 真菌类群相差较大且高通量测序检测到大量新的真菌序列 总体上高通量测序方法具有通 量大产出数据多的优势可更全面更准确地反映烟叶表面微生物群落结构 关键词克隆文库 高通量测序 细菌 真菌 烟叶 中图分类号 文献标识码

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