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生态毒理基因组学——
后基因组时代生态毒理学的新领域1
端正花,朱琳
南开大学环境科学与工程学院 (300071)
E-mail :nanke2003@126.com;zhulin@
摘 要:基因组学、蛋白组学和代谢组学技术给生态毒理学的发展提供了生物高通量的技术
手段,构成了新的交叉学科——生态毒理基因组学,它着重研究了环境毒物暴露下非靶生物
基因和蛋白的表达,将生态毒理学推向了新的理论和技术发展阶段。生态毒理基因组学的技
术支持和生物平台在后基因组时代得到了极大的发展,为生态风险评价提供了更准确的依
据。而且,生态毒理基因组学技术在我国也得到了广泛应用。
关键词:生态毒理基因组学;组学技术;模式种;风险评价
21 世纪各种高科技新产品的发明速度越来越快,应用也越来越广泛,而新物质比如说
转基因产品是否对人体和环境造成潜在危害,这些都没有定论,这就需要更高水平的毒理监
测手段的嵌入。在基于基因功能研究的后基因组时代,现有的生物理论和方法暴露出了越来
越大的局限性,组学技术(omics technology )包括基因组学、蛋白组学和代谢组学的发展
为生态毒理学新测试系统的建立提供了良好的契机,促进了新的交叉学科—生态毒理基因组
学的产生。虽然不同种属对环境暴露反映的差异可能与编码蛋白质基因的遗传多态性有关,
但也可能是不同种属的反应具有相同的毒性机制,因此,动物实验观察到的基因表达的改变
可能作为生物标志物,用于预测对人的毒性。这些都为生态风险评价提供了更准确的技术依
据。
1 生态毒理基因组学的发展历程
生态毒理学是70 年代初期发展起来的一个毒理学分支,是生态学与毒理学之间相互渗
透的一门边缘学科,它的出现,在很大程度上是由于环境污染促使传统的毒理学从研究个体
效应扩大到群体效应而产生[1] 。原则上,环境污染物会诱导生物的基因反应。在生物医学上,
基因表达的改变几乎毫无例外的是直接或间接的毒物暴露的结果[2] 。随着分子生物学在后基
因组时代的发展,基因组技术能直接应用于诊断在环境和化学物质的刺激下,生物的基因和
蛋白表达。对于一个目标环境区域和污染地带,生态毒理学能起到关键作用。能够发现:哪
些基因被表达,它们有什么功能;是否在环境变化下,基因表达发生了变化,这种变化是否
是适应性的;生态系统、种群和个体水平的分子转化是否被这些基因操纵。
[3]
许多先进的分子生物学技术,特别是DNA微阵列技术在毒理学中的应用 ,将毒理学的
理论和技术发展带入了新的阶段。近几年科学家们越来越频繁地使用“ 毒理基因组学
1本课题得到国家自然科学基金资助。
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(toxicogenomics)”这一新概念,并预言其将为毒理学的发展带来巨大影响。毒理基因组学的广
义为[4] :研究基因组结构、活动与外来化合物产生的有害生物效应之间关系的学科。毒理基
因组学是毒理学研究和分析的巨大进步,主要表现在:更详尽的毒理分子机理的评价;物质
毒性的快速扫描;风险评价中更可靠的实验动物向人类外推[5] 。毒理基因组学研究探讨特定
环境下非易感个体和易感个体的基因表达谱,全面了解在DNA修复、毒物代谢和信号传导
等途径中相关基因的表达改变,从而避免了对大样本的易感基因的盲目筛选和对单个基因
的易感机制。
将毒理基因组技术应用于生态毒理学上,则构成了一门新的交叉科学——生态基因毒理
组学(ecotoxicogenomics )。2003 年Orphanids G将生态基因毒理组学定义为:对环境毒物
暴露有重要反应的非靶生物基因和蛋白表达的研究[6] 。生态基因毒理组学的数据是独立于其
他毒理基因组学数据的,它以生态毒性为研究对象,具有不同的实验设计类型 (非受控的现
场实验、非受控的条件
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