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第四章 生物信息及传递(下)3
第四章 生物信息的传递(下) ——翻译(从mRNA-蛋白质) 4.4 蛋白质合成的生物学机制 4.4.1 氨基酸的活化 氨基酸在进行合成多肽链之前,必须在氨酰-tRNA合成酶的作用下生成活化氨基酸——AA-tRNA。 4.4.2 翻译的起始 蛋白质合成的起始是指在模板mRNA编码区5’端形成核糖体-mRNA-起始tRNA复合物并将甲酰甲硫氨酸放入核糖体P位点。 原核生物中30S小亚基首先与mRNA模板相结合,再与fMet-tRNAfMet结合,最后与50S大亚基结合 真核生物中,40S小亚基首先与Met-tRNAMet相结合,再与模板mRNA结合,最后与60S大亚基结合生成80S·mRNA·Met-tRNAMet起始复合物。 起始复合物的生成除了GTP外,还需要Mg2+、NH4+及3个起始因子(IF-1、IF-2、IF-3)。 30S亚基具有专一性的识别和选择mRNA起始位点的性质,IF-3协助该亚基完成这种选择。 Shine及Dalgarno等证明几乎所有原核生物mRNA上都有一个5’-AGGAGGU-3’序列,这个富嘌呤区与30S亚基上16S rRNA 3’末端的富嘧啶区5’-GAUCACCUCCUUA-3’相互补。 SD序列(Shine-Dalgarno sequence) 存在于原核生物起始密码子AUG上游7~12个核苷酸处的一种4~7个核苷酸的保守片段,它与16S rRNA 3’端反向互补,所以可将mRNA的AUG起始密码子置于核糖体的适当位置以便起始翻译作用。根据首次识别其功能意义的科学家命名。 细菌核糖体上一般存在三个与氨基酰-tRNA结合的位点,即A位点(aminoacyl site),P位点(peptidyl sit)和E位点(Exit site)。只有fMet-tRNAfMet能与第一个P位点相结合,其它所有tRNA都必须通过A位点到达P位点,再由E位点离开核糖体。 三种起始因子 IF-1 IF-2 IF-3 辅助IF-3 70S起始复合物生成后促进IF-2释放 有GTP酶活性 特异识别fmet-tRNAfmet 形成fmet-tRNAfmet- IF-2-GTP 是30S起始复合物与50S亚基连接所必须 促进30S小亚基结合mRNA 终止时:促使核糖体解离 2.真核生物翻译的起始 真核生物蛋白质生物合成的起始基本与原核生物相同,只不过其核糖体较大,有较多的起始因子,mRNA具有m7GpppNp帽子结构,Met-tRNAMet不甲酰化,mRNA分子5’端的“帽子”和3’端的多聚A都参与形成翻译起始复合物(图4-14)。 除了帽子结构以外,40S小亚基还能识别mRNA上的起始密码子AUG。Kozak等提出了一个“扫描模型”来解释40S亚基对mRNA起始密码子的识别作用。按照这个模型,40S小亚基先结合在mRNA5‘ 端的任何序列上,然后沿mRNA移动直至遇到AUG发生较为稳定的相互作用,最后与60S亚基一道生成80S起始复合物。 40S小亚基之所以能在AUG处停下,可能是由于Met-tRNAiMet的反密码子与AUG配对的结果。 4. 4. 3 肽链的延伸 生成起始复合物,第一个氨基酸(fMet/Met-tRNA)与核糖体结合以后,肽链开始伸长。按照mRNA模板密码子的排列,氨基酸通过新生肽键的方式(图4-16)被有序地结合上去。 肽链延伸中的每个循环都包括 AA-tRNA与核糖体结合 肽键的生成 移位 图4-17细菌中肽链延伸的第一步反应:第二个氨基酰-tRNA的结合。该氨基酰-tRNA首先与EF-Tu·GTP形成复合物,进入核糖体的A位,水解产生GDP并在EF-Ts的作用下释放GDP并使EF-Tu结合另一分子GTP,进入新一轮循环。 由于EF-Tu只能与fMet-tRNA以外的其他AA-tRNA起反应,所以起始tRNA不会被结合到A位上,mRNA内部的AUG不会被起始tRNA读出,肽链中间不会出现甲酰甲硫氨酸。 图4-18细菌中肽链延伸的第二步反应:肽键的生成。 在核糖体·mRNA·AA-tRNA复合物中,AA-tRNA占据A位,fMet-tRNAfMet占据P位。 在50S亚基上肽基转移酶(peptidyl transferase)的催化下,P位的肽(氨)酰-tRNA把肽(或氨酰基)转给A位的AA-tRNA,并以肽键相连 。 起始tRNA在完成使命后离开核糖体P位点,A位点准备接受新的AA-tRNA,开始下一轮合成反应。 图4-18细菌中肽链延伸的第三步反应:移位。核糖体通过EF-G介
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