美洲异源四倍体野生稻中倍增基因的进化及表达差异的分析研究.pdf

摘要 多倍化是植物进化的重要驱动力，大约70％的植物在历史上经历了一次或多次多倍 化事件。多倍化的直接结果是导致基因或基因组的重复。为理解倍增基因在多倍体内如何 倍体野生稻：D．a／taSwallen．，D Desv．为研究对象， grandiglumis(Doell)Prod．和D．肠，的l／a 直接从DNA序列分析和基因表达差异入手，开展倍增基因在多倍体物种中的分子进化研 究。探讨相同染色体组拷贝在不同多倍体物种中，不同染色体组拷贝在相同多倍体物种中 的进化模式和进化动态，具体研究内容和结果如下： 一、倍增基因在多倍体中的核苷酸序列进化 倍体野生稻15个样品中的核苷酸序列比对发现，3个基因总体的核苷酸多样性水平偏低， 物种间以及不同基因片段之间存在不一致的核苷酸多样性水平。其中，Lhsl基因中3个物 种的所有C染色体组拷贝的多态性都略低于D染色体组拷贝；Waxy基因片段中D．肠f扣，胁 alta物种的C染色体组 物种C染色体组拷贝的多态性恰好是D染色体组拷贝的2倍，D 拷贝的多态性则低于D染色体组拷贝，而D II基因片段，Dalta和D．砌帕砌物种两个染色体组拷贝的核苷酸多样性水平比较接近， 但Dgrandilumm物种C染色体组拷贝的多态性比D染色体组的2倍还多。 一处最小重组事件外，在其它基因和物种中均没有发现重组事件。一系列的中性检验表明， alta和D 色体组拷贝；Waxy基因上的D taafo砌物种的D染色体组拷贝以及D lat@lfa 物种的C染色体组拷贝存在有意义的P值外，其他检测均没有发现偏离中性进化的结果。 二、倍增基因表达差异的研究 测序相结合的方法对3个物种中11个样品的幼叶器官在转录水平上的表达模式进行的研 究，发现异源多倍体中倍增基因对转录物的贡献是不均等的。不同基因、不同物种甚至是 同一物种的不同样品之间，同源基因的表达水平存在差异。其中，D 101405样品和D．1atifolia物种105557样品分别在Adhl、GbssII基因中表现出D染色体组 基因沉默，沉默虽然表现出染色体组特异性，但没有表现出物种特异性。这种基因沉默与 两个测试样品的核苷酸序列变异信息是一致的。 子；淀粉粒结合淀粉合成酶；中性进化；基因表达；转录物；基因沉默 ABSTRACT hasbeenall Polyploidization in force importantdriving 70 of plantevolution；aboutpefcent have higherplants once experienced ormoreintheir polyploidization evolutionaryhistory．The directresultof of polyploidization or i§duplicationgene three genome．Using with CD Oryzaspecies