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【2017年整理】第2章-2D构型图-chemdraw2017
第二章 ChemDraw化学作图软件 1、软件介绍 ChemDraw是ChemOffice中使用最为频繁的组件,是国际上绝大多数杂志指定的论文排版软件,为不同的杂志备有不同的模板,应用最为广泛。 其理念是“化学家能懂的,ChemDraw也应该懂”。 3、绘制与编辑典型化学物质结构式 ① 键的产生: 点位后,向某个方向拖动可以产生。 直接单击,产生所选择类型的化学键,连续点击两键相连默认角度为120度。 点位位于一键的起点(显示小蓝块),沿键拖动会产生重键。 点位为于键中间,单击同样可以产生重键(三键点击后变单键)。 ③ 键及元素文本属性的设置: (2)环工具:主工具面板中提供了10种环工具命令,其中在模板命令中还有芳香化合物模板和双环模板可以绘制环状化合物。环的绘制 例子 ChemDraw 练习 1 ChemDraw 练习 1 可通过按住Shift键不放一次选择多个目标 注意并不是矩形框内的对象均被选中,只有用黑方块标识的对象才为所选对象 放大、缩小操作 通过调整矩形框四周选择区域进行目标放大、缩小、拉伸以及压缩等操作 旋转操作 从Object菜单中有关选择的选项来控制旋转角度,或者直接通过选择区域的旋转光标块进行旋转 旋转控制光标块 对象属性编辑操作 选择对象后,点击鼠标右键来修改对象属性 原 子 属 性 控 制 编辑原子标识 修改原子性质 显示原子编号 原子电荷 自由基标识 化 学 键 属 性 控 制 单、双、三、四重键 键的位置 键的拓扑结构(环/链) 可对键的属性(粗细、长短进行修改) 键的颜色 其中单键的属性有: 总共包括如下化学键: 分 子 属 性 控 制 包括旋转、原子和键属性、文本属性、背景边框或括号、性质分析以及整合等 (3) 简单分子结构的绘制 丹参醌 绘制过程: 选择合适模板,建立构型框架 利用化学键选择按钮增加侧链取代基 说明: 在默认情况下,键长是固定的,不能通过拖动来调整新加的键的长度,此时可将Object菜单中的Fixed Lengths未选后,可拉长或缩短新加的化学键 在绘制构型过程中,程序自动检查构型的合理性,并将有可能出现问题的地方用红色圈出 该C原子配位数过高 选择化学键,修改键的类型 说明: 选择所要修改的键,然后点击鼠标右键进行修改 对于单键修改为双键,最简便方法是选择实单键工具按钮后单击所要修改的单键即可 该方法适用于其它类型化学键的修改 例如: 对于双键的修改也可用类似的方法获得不同表示方式的双键: 选择原子,修改原子类型 说明: 修改原子类型的方法有三种: (a) 选择原子后点击右键,选择Edit Label选项 (b)直接用文本按钮选择后进行修改 (c)选择各种化学键(单、双键等均可)按钮后双击所要修改的原子 选择整个分子,旋转使之处于合适角度 作进一步处理,包括显示原子编号,加背景框 鼠标右键,修改分子属性 (1)键工具: 主工具图标板上提供了九个键操作的命令,其中双键命令板中的子菜单中还包 括12个键命令。利用键工具进行结构绘制操作的基本操作:首先在命令面板中选取键命令,绘制的基本操作是“点位”、 “拖动”和“点击”。 绘制分子结构的基本操作 官能团或元素符号的输入 ②元素符号的输入: 目标设置窗口 面板中选取相应的环命令后,直接在绘制区点击可产生相应的环。点住鼠标左键不放,拖动鼠标可以对环的大小,放置的角度进行自由改变。 环己烷的椅式构型直接点击为水平放置,按Shift键点击可由水平变为垂直。 在面板中任选一环命令,按Ctrl键点击,可以在环中产生不定域共轭圈。 ChemDraw是美国Cambridge (剑桥)软件公司出品的商业软件Chemoffice中的一个组成模块。功能有:分子命名及自动产生结构、可以预测所绘制分子的NMR图谱、物理化学性质以及绘制试验仪器装置图等。 版本:Ultra 10.0(附带在ChemOffice 2006),可到下载试用版本 (1) 操作界面 2. 软件主要使用方法 菜单栏说明 文件菜单:用于文件操作和打印等(扩展名为cdx) 默认操作选项设置 文档设置 部分国外化学刊物默认文档设置,包括ACS、RSC等出版社 文 档 设 置 包括页面、页眉/页脚、绘图默认参数、文档标题、原子标记字体以及背景和前景色等设置 默认操作选项设置 包括模型构造/显示、警告信息、默认文件打开和存储等选项 编辑菜单:构型复制和粘贴操作(提供与WORD等其他程序接口) Word, PowerPoint文档中 产生3D构型图 产生3D构型图 显示菜单:用于控制工具条以及窗口的显示/隐藏 依次为: 分析、化学性质、作图信息、周期表以及字符表窗口 页面视图的控制(放大/缩小等) 控制警告信息的显示 控
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