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第十章 蛋白质、多肽的氨基酸组成及序列分析
氨基酸是组成肽和蛋白质的基本单位,也是生物体维持生长所必需的营养物质,它们参与机体的代谢过程,具有广泛的生物活性和特殊的生理功能。在对肽和蛋白质的结构和功能进行研究时,往往需要将其进行完全水解,测定其氨基酸的组成;生物体内游离氨基酸在神经信息传递、代谢的调节以及肽、蛋白质的合成等生理过程中起着重要作用,为了了解其生理功能及某些外源性刺激对其功能的影响,也需要对生物体液、细胞或组织内的游离氨基酸进行分析。除了氨基酸总量测定外,往往更需要对个别氨基酸进行分析。常用的氨基酸分析方法可归纳为两类:衍生化间接分析法和无需衍生化的直接分析法。
蛋白质的一级结构即蛋白质中多肽链氨基酸的排列顺序,既是研究蛋白质分子高级结构和功能的基础,又有助于蛋白质的基因结构的研究。在某些特定情况下,基因突变常常导致蛋白质中氨基酸的序列发生改变,从而引起功能失调和疾病产生。因此,测定蛋白质的氨基酸序列对新的诊断学方法开发、新的治疗方法建立有重要的意义。
无论是游离氨基酸还是水解氨基酸的测定,由于多数氨基酸都缺少结构检测特征,既无紫外吸收,又无荧光,必须使之衍生,转化为具有紫外可见光吸收或能产生荧光的物质才能检测分析。
§10. 1. 1 氨基酸的衍生化反应
为了使测定氨基酸的方法灵敏度高,分辨率好,氨基酸的衍生化是关键步骤之一。近年来人们致力于开发灵敏度高、衍生操作简单、形成的氨基酸衍生物稳定的衍生化试剂。常见的衍生化试剂有茚三酮、邻苯二甲醛(OPA)、丹酰氯(Dansyl-Cl)、异硫氢苯酯(PITC)、氯甲酸芴甲酯(FMOC-Cl)等。
茚三酮在酸性(pH = 3 ~ 4)和加热条件下与氨基酸反应生成氨、二氧化碳和蓝-紫色的复合物(最大吸收波长为570 nm):
(10.1)
除了(-氨基酸外,其它的氨基酸也可生成有色物质,但无二氧化碳生成,(-,(-,(-和(-氨基酸比(-氨基酸反应慢得多,生成的是蓝色物质,而亚氨基酸(脯氨酸和羟脯氨酸)与茚三酮反应形成黄色化合物(最大吸收波长为440 nm)。氨基酸与茚三酮的反应主要用于柱后衍生,也可用于氨基酸的比色分析,是公认的氨基酸总量的定量方法。在定量分析时,必须除去对测定有干扰的蛋白质、氨和尿素。
邻苯二甲醛(OPA)与巯基试剂,通常与(-巯基乙醇连用,在碱性条件下与第一级氨基酸迅速反应生成1-硫代-2-烷基异吲哚,加成物可产生荧光,在紫外区也有较强的吸收,反应式如下:
(10.2)
该反应不仅适用于柱前衍生,也适用于柱后衍生,它既可进行高灵敏度的荧光检测((ex = 340 nm ,(em = 450 nm),检测限达~mol L-1,也可进行一般的紫外检测(最大吸收波长为230 nm),检测限达5mol L-1。紫外检测的线性范围为10 ~ 200 pmol,荧光为0.8 ~ 15 pmol,OPA本身不干扰分离和检测,不必除去过量试剂,色谱图基线也比较平稳。OPA法主要的缺点是:(1)亚氨基酸不能与其直接反应,需先氧化(如用次氯酸钠)开环后才能反应。(2)荧光产物不稳定。
丹酰氯(Dansyl-Cl)在碱性条件下与氨基酸反应生成强荧光物质,它同一级、二级氨基酸都能起反应,但是反应速率比较慢,在室温条件下需35 min左右,反应产物的转化率与反应时间关系较大,反应温度升高可以加速产物转化,但最高不可超过60℃,否则Dansyl-Cl会发生水解,反而使产物转化率降低。
(10.3)
Dansyl-氨基酸在酸性条件下(pH = 2 ~ 3)一般可被乙酸乙酯抽提,大量的Dansyl-Cl的反应副产物Dansyl-OH留在水相,干扰因素减小。但是Dansyl-精氨酸、Dansyl-天冬氨酸、Dansyl-谷氨酸、Dansyl-丝氨酸和Dansyl-苏氨酸则大部分或部分留在水相,往往会被遗漏,而导致错误结论。
Dansyl-Cl法的检测限与OPA法相当,线形范围一般在15 ~ 150 pmol。优点是(1)衍生物比较稳定,一般可放置12 ~ 24 h;(2)Dansyl-Cl胱氨酸衍生物线性关系好,可用于体液中胱氨酸的定量测定。缺点是(1)反应时间必须严格控制;(2)衍生物对紫外光照比较敏感,故反应要在避光条件下进行;(3)易生成多级衍生物,如赖氨酸、组氨酸、色氨酸生成二级衍生物。
异硫氰苯酯(PITC)可以和一级、二级氨基酸反应,在室温条件下仅十分钟即可完成,反应产物具有紫外吸收(最大吸收波长为254 nm)。PITC的衍生物单一、稳定,-20 ℃可贮存数月,4 ℃水溶液可保存3天; 分析时间短,结果准确,紫外检测限可达1 pmol。
(10.4)
PITC法最大的缺点就是氨基酸衍生时需要真空干燥以除去过量试剂。
氯甲酸芴甲酯(FMOC-Cl)能与一级、二级氨基酸
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